More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1212 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
293 aa  592  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  40.43 
 
 
284 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  38.04 
 
 
289 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  37.68 
 
 
289 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 
287 aa  199  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  40.07 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  42.91 
 
 
306 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  37.82 
 
 
290 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 
306 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  40.82 
 
 
308 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  40.82 
 
 
308 aa  188  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  41.64 
 
 
311 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  42.09 
 
 
297 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 
309 aa  182  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  39.58 
 
 
287 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  39.24 
 
 
286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  37.15 
 
 
288 aa  178  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  41.22 
 
 
288 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2042  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 
329 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416275  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  41.88 
 
 
288 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  43.07 
 
 
289 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  40.88 
 
 
287 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  41.88 
 
 
288 aa  176  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  40.79 
 
 
288 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  39.3 
 
 
287 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  39.86 
 
 
291 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  38.26 
 
 
297 aa  168  8e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  40.29 
 
 
293 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  37.67 
 
 
287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  36.23 
 
 
291 aa  162  7e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  45.96 
 
 
270 aa  162  9e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0982  alpha/beta hydrolase fold  39.8 
 
 
308 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  36.88 
 
 
283 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  38.63 
 
 
289 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  37.08 
 
 
308 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  36.59 
 
 
303 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3189  alpha/beta hydrolase  37.41 
 
 
306 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  37.01 
 
 
328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5601  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 
303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.988839 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  37.94 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  34.52 
 
 
300 aa  145  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  32.42 
 
 
313 aa  145  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  34.69 
 
 
304 aa  144  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 
292 aa  143  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0770  alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 
325 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1129  alpha/beta hydrolase fold protein  35.81 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  35.89 
 
 
301 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  38.57 
 
 
304 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0688  alpha/beta hydrolase fold protein  36.6 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  35.52 
 
 
307 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0708  alpha/beta hydrolase fold  35.95 
 
 
309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.149589 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  33.68 
 
 
295 aa  132  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  32.13 
 
 
307 aa  132  6.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  37.63 
 
 
308 aa  129  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  32.92 
 
 
323 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  34.72 
 
 
305 aa  126  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  35.21 
 
 
308 aa  126  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 
276 aa  123  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  38.57 
 
 
307 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  38.7 
 
 
294 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  34.84 
 
 
349 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  37.98 
 
 
307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.85 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  32.29 
 
 
323 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  32.28 
 
 
317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  33.65 
 
 
324 aa  116  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6199  alpha/beta hydrolase fold protein  32.33 
 
 
296 aa  115  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82135  normal  0.298395 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  32.87 
 
 
288 aa  113  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  32.53 
 
 
299 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  38.22 
 
 
310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  35.37 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  45.22 
 
 
310 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.78 
 
 
313 aa  109  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 
274 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  31.38 
 
 
287 aa  106  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
291 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 
287 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
291 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
291 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
291 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  25 
 
 
319 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
277 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
291 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  31.66 
 
 
273 aa  103  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  33.8 
 
 
568 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1384  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
320 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  34.4 
 
 
308 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
298 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0496  alpha/beta hydrolase fold  35.52 
 
 
284 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0485  alpha/beta hydrolase fold  35.52 
 
 
284 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.891583  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0507  alpha/beta hydrolase fold  35.52 
 
 
284 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.697131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  32.52 
 
 
294 aa  99.4  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4242  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 
271 aa  99.4  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.992424  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  29.39 
 
 
311 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  29.39 
 
 
311 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  29.47 
 
 
315 aa  99  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  29.93 
 
 
311 aa  98.2  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  30.11 
 
 
296 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 
294 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>