More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3236 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 308 aa  629  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  45.6 
 
 		 323 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  42.16 
 
 		 317 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  42.44 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  44.41 
 
 		 302 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  41.91 
 
 		 315 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  41.64 
 
 		 323 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  41.72 
 
 		 322 aa  229  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  41.39 
 
 		 315 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  39.8 
 
 		 312 aa  223  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 324 aa  221  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  39.8 
 
 		 337 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  40.67 
 
 		 315 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  42.05 
 
 		 315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  42.05 
 
 		 315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  41.39 
 
 		 341 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  41.78 
 
 		 323 aa  212  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  38.07 
 
 		 344 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3309  alpha/beta hydrolase fold  36.72 
 
 		 321 aa  192  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244903  hitchhiker  0.0000365568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  37.87 
 
 		 328 aa  189  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.99 
 
 		 350 aa  189  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  35.26 
 
 		 351 aa  186  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  39.14 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  35.97 
 
 		 323 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  34.74 
 
 		 356 aa  179  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  35.06 
 
 		 334 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 		 331 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  32.69 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3843  alpha/beta hydrolase fold  34.67 
 
 		 316 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  33.77 
 
 		 323 aa  149  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0515  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 343 aa  142  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3311  alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 		 351 aa  135  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000971087  hitchhiker  0.0000356017 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5947  alpha/beta hydrolase fold  30.73 
 
 		 390 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00350915 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  31.39 
 
 		 301 aa  126  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 		 308 aa  125  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  32.13 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  27.36 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7125  putative epoxide hydrolase  28.65 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.675745  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6110  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 376 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173305  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  31.48 
 
 		 283 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.87 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5871  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 		 376 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0276  alpha/beta hydrolase fold  30.75 
 
 		 434 aa  113  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  29.97 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 		 287 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  48.28 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9230  epoxide hydrolase  29.43 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.247355  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  27.83 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  28.8 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 		 349 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  48.28 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  29.74 
 
 		 307 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 		 291 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2842  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 434 aa  109  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  27.94 
 
 		 494 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.89 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  25.66 
 
 		 289 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  37.06 
 
 		 292 aa  105  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 291 aa  105  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  25.66 
 
 		 289 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  38.12 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  32.3 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 288 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  45.69 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  40.4 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.65 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  27.36 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0495  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 		 345 aa  99.4  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 287 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 288 aa  99  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  29.94 
 
 		 287 aa  99  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  43.1 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  42.24 
 
 		 310 aa  97.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  46.23 
 
 		 289 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  25.99 
 
 		 299 aa  96.3  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 287 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 		 287 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  29.13 
 
 		 289 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  44.83 
 
 		 306 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  44.83 
 
 		 306 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4021  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 341 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.655043  normal  0.26756 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>