More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1477 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 308 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  96.75 
 
 		 308 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  88.47 
 
 		 311 aa  546  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  71.24 
 
 		 306 aa  454  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  71.24 
 
 		 306 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0982  alpha/beta hydrolase fold  44.84 
 
 		 308 aa  252  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5601  alpha/beta hydrolase fold  42.16 
 
 		 303 aa  245  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988839 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3189  alpha/beta hydrolase  45 
 
 		 306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0708  alpha/beta hydrolase fold  45.05 
 
 		 309 aa  239  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149589 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0688  alpha/beta hydrolase fold protein  44.87 
 
 		 309 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0770  alpha/beta hydrolase fold  44.95 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1129  alpha/beta hydrolase fold protein  41.47 
 
 		 303 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  40.69 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  35.58 
 
 		 309 aa  206  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  40.54 
 
 		 301 aa  206  5e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  40.41 
 
 		 288 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 		 287 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2042  alpha/beta hydrolase fold  32.51 
 
 		 329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416275  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  37.76 
 
 		 289 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  40.82 
 
 		 293 aa  188  9e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  37.41 
 
 		 289 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  38.68 
 
 		 283 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  38.68 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  36.33 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  37.8 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 		 287 aa  179  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  42.25 
 
 		 270 aa  173  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  35.96 
 
 		 297 aa  172  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  34.94 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  37.25 
 
 		 287 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  35.84 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  36.49 
 
 		 328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  34.32 
 
 		 295 aa  162  9e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  35.06 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  34.54 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  35.27 
 
 		 288 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  34.93 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  36.58 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  34.78 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 		 303 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.33 
 
 		 293 aa  139  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  35.07 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 287 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  33.03 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  30.93 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  35.11 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  29.97 
 
 		 334 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  30.43 
 
 		 322 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  33.75 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 		 349 aa  122  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6199  alpha/beta hydrolase fold protein  31.13 
 
 		 296 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82135  normal  0.298395 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  30.91 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  29.69 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4242  alpha/beta hydrolase fold protein  30.41 
 
 		 271 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.992424  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  31.44 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  31.74 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  30.27 
 
 		 296 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  30.27 
 
 		 296 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  30.27 
 
 		 296 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  30.27 
 
 		 296 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  30.27 
 
 		 311 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  30.27 
 
 		 311 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  30.03 
 
 		 341 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  31.41 
 
 		 349 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0495  alpha/beta hydrolase fold protein  46.02 
 
 		 345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5124  alpha/beta hydrolase fold protein  33.56 
 
 		 272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  32.31 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  30.03 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  30.26 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  31.51 
 
 		 294 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  27.81 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>