More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0770 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0770  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
325 aa  666    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3189  alpha/beta hydrolase  69.18 
 
 
306 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0982  alpha/beta hydrolase fold  62.7 
 
 
308 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1129  alpha/beta hydrolase fold protein  56.39 
 
 
303 aa  354  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0688  alpha/beta hydrolase fold protein  60.06 
 
 
309 aa  347  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0708  alpha/beta hydrolase fold  59.81 
 
 
309 aa  345  4e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.149589 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5601  alpha/beta hydrolase fold  51.26 
 
 
303 aa  313  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.988839 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  45.57 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  44.95 
 
 
308 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  44.86 
 
 
311 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  45.45 
 
 
306 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 
306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2042  alpha/beta hydrolase fold  32.72 
 
 
329 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416275  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 
309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  34.38 
 
 
301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  33.13 
 
 
307 aa  151  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 
293 aa  149  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  32.57 
 
 
297 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 
304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  33.01 
 
 
291 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 
287 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 
290 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  31.1 
 
 
295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 
313 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
289 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  28.75 
 
 
287 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
289 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
289 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 
284 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  31.63 
 
 
287 aa  122  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  33.01 
 
 
287 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  30.72 
 
 
297 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  33.23 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 
283 aa  119  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  31.83 
 
 
288 aa  119  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 
286 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 
288 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  30.84 
 
 
289 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.38 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  33.01 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  30.26 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  31.29 
 
 
311 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  31.29 
 
 
311 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  31.29 
 
 
349 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  31.29 
 
 
296 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  31.29 
 
 
296 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  31.29 
 
 
296 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  31.29 
 
 
296 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  30.87 
 
 
296 aa  109  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 
287 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 
288 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 
270 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 
292 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 
288 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4242  alpha/beta hydrolase fold protein  29.61 
 
 
271 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.992424  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 
291 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5124  alpha/beta hydrolase fold protein  33.02 
 
 
272 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
303 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
315 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 
281 aa  98.2  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 
291 aa  96.7  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
312 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  29.87 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 
315 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 
317 aa  93.6  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  28.45 
 
 
315 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  30.15 
 
 
302 aa  92.4  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 
281 aa  92.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.84 
 
 
278 aa  91.3  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 
309 aa  90.9  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6199  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 
296 aa  90.1  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82135  normal  0.298395 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 
323 aa  90.1  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 
337 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  29.94 
 
 
305 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0485  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
284 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.891583  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0496  alpha/beta hydrolase fold  29.49 
 
 
284 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0507  alpha/beta hydrolase fold  29.49 
 
 
284 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.697131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 
305 aa  87  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  30.38 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 
331 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0495  alpha/beta hydrolase fold protein  35.07 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  25.29 
 
 
334 aa  82.4  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  23.89 
 
 
323 aa  82.4  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  26.07 
 
 
322 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  25.5 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3843  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
277 aa  80.1  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  25.07 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 
307 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  27.71 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  28.66 
 
 
307 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>