More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5601 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5601  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 303 aa  612  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988839 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0688  alpha/beta hydrolase fold protein  58.69 
 
 		 309 aa  344  8e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0708  alpha/beta hydrolase fold  57.98 
 
 		 309 aa  340  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149589 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0982  alpha/beta hydrolase fold  55.95 
 
 		 308 aa  334  9e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0770  alpha/beta hydrolase fold  51.26 
 
 		 325 aa  301  6.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3189  alpha/beta hydrolase  49.18 
 
 		 306 aa  286  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1129  alpha/beta hydrolase fold protein  49.02 
 
 		 303 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  42.48 
 
 		 308 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  42.16 
 
 		 308 aa  245  8e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  41.81 
 
 		 311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  41.92 
 
 		 306 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  41.72 
 
 		 306 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2042  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416275  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  31.77 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  34.2 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 		 293 aa  153  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  33.55 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  34.58 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  35.45 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 		 297 aa  146  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  32.07 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  33.56 
 
 		 295 aa  142  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 		 289 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 		 284 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 		 288 aa  135  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 		 287 aa  135  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 		 286 aa  133  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  34.95 
 
 		 289 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  34.56 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  36.15 
 
 		 270 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  32.68 
 
 		 300 aa  124  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  32.19 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  30.72 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  32.57 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  34.27 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  32.19 
 
 		 288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 		 288 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  32.19 
 
 		 288 aa  119  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  32.69 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 313 aa  115  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  33.57 
 
 		 287 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  30.26 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  32.13 
 
 		 281 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.8 
 
 		 293 aa  99.4  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 304 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  32.65 
 
 		 296 aa  95.5  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  32.64 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  32.64 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  32.64 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  32.64 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  32.64 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  32.64 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  32.64 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  31.65 
 
 		 308 aa  92.4  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4242  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 271 aa  92.4  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.992424  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0495  alpha/beta hydrolase fold protein  41.96 
 
 		 345 aa  92.4  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.17 
 
 		 278 aa  92.4  9e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 		 291 aa  92.4  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05183  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14860)  28.43 
 
 		 780 aa  92  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  28.66 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  27.71 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  31.31 
 
 		 349 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 		 305 aa  89.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 		 308 aa  89.4  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  30.98 
 
 		 311 aa  89  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  28.22 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  27.41 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  35.48 
 
 		 273 aa  87.4  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  25.66 
 
 		 590 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0496  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 284 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0507  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 284 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.697131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  31.01 
 
 		 299 aa  86.3  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.42 
 
 		 602 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 328 aa  86.3  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 323 aa  86.3  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0485  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 284 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.891583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 		 331 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 315 aa  85.5  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3859  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>