More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3189 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3189  alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 306 aa  623  1e-177  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0770  alpha/beta hydrolase fold  69.18 
 
 		 325 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0982  alpha/beta hydrolase fold  65.89 
 
 		 308 aa  378  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1129  alpha/beta hydrolase fold protein  61.39 
 
 		 303 aa  362  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0688  alpha/beta hydrolase fold protein  60.06 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0708  alpha/beta hydrolase fold  60.06 
 
 		 309 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149589 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5601  alpha/beta hydrolase fold  50.82 
 
 		 303 aa  303  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  45.27 
 
 		 306 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  45.51 
 
 		 306 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  45.67 
 
 		 308 aa  254  9e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  45 
 
 		 308 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  44.52 
 
 		 311 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2042  alpha/beta hydrolase fold  36.72 
 
 		 329 aa  176  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416275  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  33.55 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  39.12 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  37.66 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  35.66 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  34.69 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  35.16 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  32.62 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  32.26 
 
 		 289 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  32.31 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 		 297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  32.99 
 
 		 304 aa  136  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 		 287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 291 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  34.81 
 
 		 287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 		 288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  34.01 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  33.79 
 
 		 328 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  31.44 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  30.85 
 
 		 284 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  33.56 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.33 
 
 		 293 aa  125  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  30.95 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4242  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 		 271 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.992424  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 287 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  32.99 
 
 		 296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  32.99 
 
 		 296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  32.99 
 
 		 296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  32.99 
 
 		 296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  32.99 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  32.99 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  32.31 
 
 		 349 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  31.27 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  32.19 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  32.29 
 
 		 296 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  31.96 
 
 		 281 aa  115  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  34.66 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  31.33 
 
 		 289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 		 291 aa  108  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5124  alpha/beta hydrolase fold protein  32.77 
 
 		 272 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0496  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 		 284 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0485  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 		 284 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.891583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0507  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 		 284 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.697131 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  34.17 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.89 
 
 		 278 aa  99  8e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6199  alpha/beta hydrolase fold protein  31.99 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82135  normal  0.298395 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 305 aa  96.7  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 276 aa  93.6  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 277 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 273 aa  90.5  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 341 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 308 aa  90.5  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  31.49 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 		 304 aa  89  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  28.13 
 
 		 315 aa  86.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 315 aa  86.7  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  28.97 
 
 		 294 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3859  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 		 278 aa  86.3  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1694  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 		 277 aa  85.9  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0287329  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  27.22 
 
 		 328 aa  85.5  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  28.53 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  28.53 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  27.47 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  28.13 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0495  alpha/beta hydrolase fold protein  35.77 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>