More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1694 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1694  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 277 aa  558  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0287329  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 291 aa  248  9e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4242  alpha/beta hydrolase fold protein  45.72 
 
 		 271 aa  205  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.992424  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  45.85 
 
 		 276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  44.84 
 
 		 309 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  42.96 
 
 		 283 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  39.55 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  39.54 
 
 		 277 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  43.02 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  36.53 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5124  alpha/beta hydrolase fold protein  42.69 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  39.03 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  39.93 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  39.93 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  39.93 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  39.93 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  39.93 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  39.93 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  39.93 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6199  alpha/beta hydrolase fold protein  35.53 
 
 		 296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82135  normal  0.298395 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.02 
 
 		 293 aa  138  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  37.97 
 
 		 296 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  38.82 
 
 		 274 aa  136  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  38.93 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 		 308 aa  129  7.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3859  alpha/beta hydrolase fold  37.32 
 
 		 278 aa  126  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0485  alpha/beta hydrolase fold  40.38 
 
 		 284 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.891583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0496  alpha/beta hydrolase fold  40.38 
 
 		 284 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0507  alpha/beta hydrolase fold  40.38 
 
 		 284 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.697131 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 		 283 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 		 288 aa  115  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 288 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 		 328 aa  113  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4229  alpha/beta hydrolase fold  31.66 
 
 		 328 aa  105  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 		 293 aa  105  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 		 287 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 287 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 		 288 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  28.52 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 307 aa  99  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0982  alpha/beta hydrolase fold  31.77 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 300 aa  96.3  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  30.16 
 
 		 289 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  29.24 
 
 		 334 aa  95.9  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 300 aa  95.9  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 		 289 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 		 289 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 		 289 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1129  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 		 331 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  27.14 
 
 		 295 aa  85.5  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  28.47 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3189  alpha/beta hydrolase  28.67 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  38.39 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  38.8 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  36.28 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 323 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0708  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149589 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0688  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  36.31 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  39.37 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3843  alpha/beta hydrolase fold  43.4 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>