More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1129 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1129  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 303 aa  625  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3189  alpha/beta hydrolase  61.39 
 
 		 306 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0770  alpha/beta hydrolase fold  56.39 
 
 		 325 aa  351  8e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0982  alpha/beta hydrolase fold  55.34 
 
 		 308 aa  333  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0708  alpha/beta hydrolase fold  54.69 
 
 		 309 aa  322  7e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149589 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0688  alpha/beta hydrolase fold protein  54.52 
 
 		 309 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5601  alpha/beta hydrolase fold  49.02 
 
 		 303 aa  293  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988839 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  42.52 
 
 		 311 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  40.58 
 
 		 308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  41.33 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  40.53 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  41 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 		 309 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  34.69 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2042  alpha/beta hydrolase fold  32.57 
 
 		 329 aa  157  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416275  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  35.81 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  33.86 
 
 		 307 aa  152  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 		 289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  32.19 
 
 		 301 aa  145  8.000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 		 287 aa  142  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 		 289 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  32.2 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 		 287 aa  139  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  31.54 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 		 284 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  31.29 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  30.9 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 		 286 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  31.38 
 
 		 297 aa  132  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  31.48 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  32.21 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  30.42 
 
 		 295 aa  126  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  31.77 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  31.01 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.65 
 
 		 293 aa  122  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 287 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  32.99 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  29.25 
 
 		 288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  32.64 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  29.83 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  30.3 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  30.3 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  30.3 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  30.3 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  30.3 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  30.3 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  30.3 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4242  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 		 271 aa  102  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.992424  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  30.66 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 		 270 aa  99.8  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6199  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82135  normal  0.298395 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.87 
 
 		 278 aa  92.8  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  27.3 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 308 aa  89  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  27 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 276 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1694  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0287329  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  28.71 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5124  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  28.2 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  26.93 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  28.7 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0496  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0507  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.697131 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0485  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.891583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  27.18 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05183  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14860)  24.52 
 
 		 780 aa  81.6  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  28.17 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  25.35 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  29.24 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  34.44 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  34.44 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  27.53 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1705  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565807 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  36.92 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  27.43 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  24.69 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  28.48 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540254  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>