More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1381 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 277 aa  541  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  55.27 
 
 		 273 aa  269  5e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  49.46 
 
 		 281 aa  243  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  51.69 
 
 		 276 aa  242  6e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  51.49 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  53.44 
 
 		 274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  48.74 
 
 		 296 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  48.74 
 
 		 296 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  48.74 
 
 		 296 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  48.74 
 
 		 296 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  48.74 
 
 		 311 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  48.74 
 
 		 311 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  48.74 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  48.01 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  53.45 
 
 		 278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3859  alpha/beta hydrolase fold  52.21 
 
 		 278 aa  226  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0496  alpha/beta hydrolase fold  50.18 
 
 		 284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0507  alpha/beta hydrolase fold  50.18 
 
 		 284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.697131 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0485  alpha/beta hydrolase fold  50.18 
 
 		 284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.891583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4242  alpha/beta hydrolase fold protein  47.37 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.992424  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  50.36 
 
 		 281 aa  216  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  45.42 
 
 		 283 aa  209  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  42.38 
 
 		 288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  45.28 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5124  alpha/beta hydrolase fold protein  47.01 
 
 		 272 aa  188  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6199  alpha/beta hydrolase fold protein  40.3 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82135  normal  0.298395 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  43.35 
 
 		 291 aa  175  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 283 aa  172  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  40.48 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  40.53 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  42.11 
 
 		 288 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  40.07 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  41.35 
 
 		 288 aa  165  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  40.84 
 
 		 301 aa  162  6e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  41.96 
 
 		 297 aa  162  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  42.19 
 
 		 293 aa  158  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  39.27 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1694  alpha/beta hydrolase fold protein  39.54 
 
 		 277 aa  157  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0287329  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  37.29 
 
 		 308 aa  155  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  45.69 
 
 		 289 aa  155  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  41.31 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4229  alpha/beta hydrolase fold  39.02 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  34.53 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.45 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  36.56 
 
 		 289 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  31.42 
 
 		 287 aa  139  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 		 286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  34.81 
 
 		 287 aa  135  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  34.18 
 
 		 300 aa  135  9e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 		 288 aa  125  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  31.42 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 287 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  37.82 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  37.82 
 
 		 294 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  34.77 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  36.2 
 
 		 494 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  34.56 
 
 		 292 aa  112  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 312 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  30.88 
 
 		 303 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  33.45 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 		 304 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 337 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  37.6 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  32.09 
 
 		 322 aa  107  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  35.48 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  31.93 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 293 aa  104  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  32.38 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  32.87 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  30.82 
 
 		 308 aa  99.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 306 aa  99.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 		 300 aa  99.4  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540254  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  29.54 
 
 		 311 aa  99  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  34.4 
 
 		 315 aa  99  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  30.46 
 
 		 311 aa  96.3  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  30.94 
 
 		 295 aa  96.3  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 308 aa  95.9  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  34.06 
 
 		 294 aa  95.5  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 		 308 aa  95.9  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 305 aa  95.5  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  40.98 
 
 		 334 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0688  alpha/beta hydrolase fold protein  35.08 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  40.16 
 
 		 331 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0522  Alpha/beta hydrolase fold-1  37.83 
 
 		 241 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  39.17 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>