More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3670 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 315 aa  650    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  63.28 
 
 		 314 aa  423  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  55.74 
 
 		 311 aa  369  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  40.8 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  40.06 
 
 		 331 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  41.25 
 
 		 323 aa  242  6e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  39.51 
 
 		 334 aa  228  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  40.75 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  41.01 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  41.61 
 
 		 341 aa  222  8e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  40.97 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  40.97 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 		 323 aa  205  7e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  39.42 
 
 		 312 aa  205  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  36.24 
 
 		 302 aa  195  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  37.94 
 
 		 337 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  36.19 
 
 		 315 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  36.83 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  36.57 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  37.03 
 
 		 317 aa  188  9e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 315 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0515  alpha/beta hydrolase fold  33.74 
 
 		 343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  35.33 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  31.71 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3843  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 		 316 aa  159  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  32.25 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  32.93 
 
 		 356 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3309  alpha/beta hydrolase fold  34.49 
 
 		 321 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244903  hitchhiker  0.0000365568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 		 351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  32.29 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0495  alpha/beta hydrolase fold protein  30.75 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 		 323 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 		 301 aa  132  5e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  28.71 
 
 		 289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  28.71 
 
 		 289 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 		 288 aa  125  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.11 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  30.87 
 
 		 287 aa  122  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  26.63 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 		 290 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.66 
 
 		 293 aa  119  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 		 284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 		 288 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  28.66 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  31.83 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 		 286 aa  112  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3311  alpha/beta hydrolase fold  30.81 
 
 		 351 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000971087  hitchhiker  0.0000356017 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 		 304 aa  112  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  27.39 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  31.41 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  28.48 
 
 		 303 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  28.39 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  31.14 
 
 		 349 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  31.14 
 
 		 311 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  31.14 
 
 		 311 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 		 308 aa  105  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  31.14 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  31.14 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  31.14 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  31.14 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 		 309 aa  105  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 313 aa  105  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 283 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  26.3 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4242  alpha/beta hydrolase fold protein  27.81 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.992424  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  29.49 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  30.84 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  31 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  28.48 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6398  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.234405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 307 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 306 aa  99.4  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05183  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14860)  26.37 
 
 		 780 aa  99.4  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4021  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 		 341 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.655043  normal  0.26756 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  43.65 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 287 aa  99  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 		 292 aa  98.2  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5947  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00350915 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 		 291 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>