More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3859 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3859  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 278 aa  555  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  52.59 
 
 		 311 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  52.59 
 
 		 311 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  51.28 
 
 		 281 aa  263  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  52.59 
 
 		 296 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  52.59 
 
 		 296 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  52.59 
 
 		 296 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  52.59 
 
 		 296 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  52.59 
 
 		 349 aa  261  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  51.11 
 
 		 296 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  53.79 
 
 		 281 aa  245  4.9999999999999997e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  52.21 
 
 		 277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  52.52 
 
 		 309 aa  232  5e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  51.64 
 
 		 276 aa  227  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4242  alpha/beta hydrolase fold protein  48.5 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.992424  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  47.6 
 
 		 273 aa  209  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  49.64 
 
 		 278 aa  205  8e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0485  alpha/beta hydrolase fold  46.55 
 
 		 284 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.891583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0496  alpha/beta hydrolase fold  46.55 
 
 		 284 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0507  alpha/beta hydrolase fold  46.55 
 
 		 284 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.697131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  43.33 
 
 		 283 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  40.45 
 
 		 288 aa  178  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  44.23 
 
 		 274 aa  176  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5124  alpha/beta hydrolase fold protein  43.84 
 
 		 272 aa  175  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  41.95 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  40.15 
 
 		 301 aa  172  6.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6199  alpha/beta hydrolase fold protein  38.91 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82135  normal  0.298395 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  37.28 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 		 288 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  38.64 
 
 		 328 aa  155  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1694  alpha/beta hydrolase fold protein  38.49 
 
 		 277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0287329  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  37.63 
 
 		 289 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.28 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  36.68 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 300 aa  149  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  37.55 
 
 		 283 aa  149  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 		 313 aa  145  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  35.61 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  36.3 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  36.65 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  38.87 
 
 		 307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  38.52 
 
 		 294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  29.53 
 
 		 289 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  34.57 
 
 		 288 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 		 297 aa  138  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  34.94 
 
 		 288 aa  135  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  33.83 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  36.72 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  34.2 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  33.68 
 
 		 304 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 		 284 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 		 290 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  36.43 
 
 		 308 aa  128  9.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  34.41 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  35.53 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 		 303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4229  alpha/beta hydrolase fold  31.94 
 
 		 328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0982  alpha/beta hydrolase fold  32.07 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  32.98 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  32.4 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  34.63 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 		 323 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3189  alpha/beta hydrolase  30.69 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  28.26 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5601  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  30.82 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0688  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 		 309 aa  98.2  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  31.18 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  31.53 
 
 		 317 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  32.27 
 
 		 307 aa  96.3  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 		 341 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0708  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 309 aa  95.9  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149589 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0522  Alpha/beta hydrolase fold-1  36.75 
 
 		 241 aa  95.5  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 		 337 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 		 331 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2042  alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416275  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 		 331 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 		 315 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 		 315 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 		 305 aa  92.8  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 		 314 aa  92.4  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  34.6 
 
 		 596 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  32.01 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  39.52 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  34.6 
 
 		 596 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  34.6 
 
 		 596 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>