More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1601 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
328 aa  677    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  58.84 
 
 
334 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  56.1 
 
 
331 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  54.88 
 
 
331 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  52.81 
 
 
323 aa  343  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0515  alpha/beta hydrolase fold  48.68 
 
 
343 aa  310  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  45.94 
 
 
322 aa  269  5e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  40.5 
 
 
323 aa  251  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  43.16 
 
 
314 aa  249  5e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  43.75 
 
 
341 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  43.75 
 
 
315 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  43.75 
 
 
315 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  41.14 
 
 
311 aa  243  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  40.65 
 
 
312 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  40.75 
 
 
315 aa  227  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  39.49 
 
 
337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  41.67 
 
 
323 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  39.69 
 
 
315 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  39.87 
 
 
323 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  38.44 
 
 
315 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  39.37 
 
 
317 aa  200  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3843  alpha/beta hydrolase fold  37.26 
 
 
316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  37.42 
 
 
302 aa  195  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  37.87 
 
 
308 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  36.56 
 
 
324 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  37.27 
 
 
323 aa  172  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  34.06 
 
 
288 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  32.59 
 
 
288 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  32.91 
 
 
288 aa  156  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0495  alpha/beta hydrolase fold protein  33.13 
 
 
345 aa  155  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3309  alpha/beta hydrolase fold  37.65 
 
 
321 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244903  hitchhiker  0.0000365568 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  33.83 
 
 
330 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 
344 aa  149  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 
289 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 
351 aa  143  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  30.61 
 
 
356 aa  143  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  32.15 
 
 
283 aa  142  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  33.23 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  32.83 
 
 
308 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 
291 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  31.31 
 
 
328 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 
301 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  33.03 
 
 
308 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  29.94 
 
 
287 aa  132  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  28.61 
 
 
308 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 
288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
293 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  31.21 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.52 
 
 
350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  29.26 
 
 
304 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  26.2 
 
 
289 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  26.21 
 
 
289 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
287 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 
291 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 
286 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  31.83 
 
 
300 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  28.8 
 
 
303 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  27.36 
 
 
290 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  31.09 
 
 
289 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  28.53 
 
 
306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 
284 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  31.11 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 
306 aa  119  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  38.51 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  30.19 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  30.99 
 
 
301 aa  113  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 
307 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 
287 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.28 
 
 
293 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  29.64 
 
 
311 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  30.7 
 
 
295 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 
308 aa  109  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  27.81 
 
 
292 aa  109  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3311  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 
351 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000971087  hitchhiker  0.0000356017 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
309 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
276 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 
304 aa  102  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  28.13 
 
 
307 aa  102  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 
308 aa  102  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
313 aa  102  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05183  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14860)  23.95 
 
 
780 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.64 
 
 
313 aa  100  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  29.11 
 
 
307 aa  99.8  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  26.82 
 
 
288 aa  99.4  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 
291 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  42.15 
 
 
283 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  37.7 
 
 
308 aa  97.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 
273 aa  97.4  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5947  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 
390 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00350915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 
291 aa  97.1  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 
294 aa  96.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>