More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3998 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 344 aa  702    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  68.18 
 
 		 356 aa  501  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  69.77 
 
 		 351 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  45.69 
 
 		 350 aa  298  9e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  43.73 
 
 		 330 aa  249  7e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  42.24 
 
 		 317 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  38.78 
 
 		 315 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  38.26 
 
 		 323 aa  210  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  38.71 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  37.57 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  39.54 
 
 		 322 aa  206  7e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  40 
 
 		 302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  38.07 
 
 		 308 aa  196  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  35.86 
 
 		 324 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  35.47 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  36.95 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  35.28 
 
 		 315 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  35.28 
 
 		 315 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  35.36 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  34.1 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  34.97 
 
 		 311 aa  168  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3309  alpha/beta hydrolase fold  33.82 
 
 		 321 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244903  hitchhiker  0.0000365568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3843  alpha/beta hydrolase fold  34.5 
 
 		 316 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  31.96 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9230  epoxide hydrolase  34.83 
 
 		 371 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.247355  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 		 315 aa  153  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 		 328 aa  149  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  30.61 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 		 287 aa  145  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  30.09 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6398  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 367 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.234405 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5525  alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 		 367 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6110  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173305  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5889  alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 		 367 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159226  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5871  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 		 376 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0276  alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 		 434 aa  137  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 		 288 aa  136  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  31.66 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 		 331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  53.28 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5947  alpha/beta hydrolase fold  32.7 
 
 		 390 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00350915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  53.49 
 
 		 283 aa  129  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  50.79 
 
 		 301 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3311  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000971087  hitchhiker  0.0000356017 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2842  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 		 434 aa  126  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  42.28 
 
 		 290 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0515  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  51.22 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  45.45 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0495  alpha/beta hydrolase fold protein  30.79 
 
 		 345 aa  123  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  30.41 
 
 		 297 aa  122  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  46.04 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  28.82 
 
 		 304 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  51.22 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  44.6 
 
 		 349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7125  putative epoxide hydrolase  31.67 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.675745  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  47.52 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  39.06 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  39.67 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  49.55 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  39.06 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  28.45 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  46.03 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  45.53 
 
 		 494 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  52.88 
 
 		 289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  46.83 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  47.97 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  45.52 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  46.34 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  37.64 
 
 		 310 aa  110  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  44.26 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  55.77 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  43.31 
 
 		 293 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  44.88 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  27.67 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  44.09 
 
 		 288 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 		 286 aa  105  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  50.96 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  42.03 
 
 		 270 aa  103  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  40.56 
 
 		 287 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  44.27 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  51.92 
 
 		 287 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 287 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  41.96 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  43.61 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  47.11 
 
 		 307 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  44.8 
 
 		 291 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  44.8 
 
 		 291 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  47.11 
 
 		 294 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  44.07 
 
 		 308 aa  99.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4021  alpha/beta hydrolase fold  28.49 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.655043  normal  0.26756 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  42.37 
 
 		 308 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  41.54 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>