More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6398 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6398  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 367 aa  748    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.234405 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5525  alpha/beta hydrolase fold  97 
 
 		 367 aa  711    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5889  alpha/beta hydrolase fold  97 
 
 		 367 aa  711    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159226  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5871  alpha/beta hydrolase fold  86.07 
 
 		 376 aa  631  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6110  alpha/beta hydrolase fold  85.79 
 
 		 376 aa  631  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173305  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0276  alpha/beta hydrolase fold  85.25 
 
 		 434 aa  608  1e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2842  alpha/beta hydrolase fold  83.88 
 
 		 434 aa  589  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9230  epoxide hydrolase  75.68 
 
 		 371 aa  567  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.247355  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7125  putative epoxide hydrolase  57.46 
 
 		 356 aa  381  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.675745  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5947  alpha/beta hydrolase fold  53.04 
 
 		 390 aa  362  8e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00350915 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  34.33 
 
 		 317 aa  150  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.89 
 
 		 350 aa  146  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  30.73 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  34.94 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  31.51 
 
 		 344 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  32.56 
 
 		 356 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 		 337 aa  133  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  32.51 
 
 		 323 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  33.06 
 
 		 322 aa  133  6e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 351 aa  129  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 		 315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 		 315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  31.52 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 341 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  29.19 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 		 312 aa  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  31.07 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  31.48 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 		 308 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  29.48 
 
 		 334 aa  105  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 		 315 aa  104  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  26.8 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  26.65 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0515  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 343 aa  99.8  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3309  alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244903  hitchhiker  0.0000365568 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  39.53 
 
 		 308 aa  93.2  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  42.67 
 
 		 297 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  37.88 
 
 		 283 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0495  alpha/beta hydrolase fold protein  25.94 
 
 		 345 aa  90.5  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 331 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  47.66 
 
 		 307 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 291 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  47.66 
 
 		 294 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  44.19 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  39.06 
 
 		 311 aa  87.8  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  42.97 
 
 		 307 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 292 aa  87  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  38.76 
 
 		 301 aa  85.9  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  41.41 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  42.52 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  40.62 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  36.43 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  38.17 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  34.03 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11147  epoxide hydrolase ephC  42.75 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  40.31 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  36.81 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  36.81 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  24.17 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  41.73 
 
 		 494 aa  79.7  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  35.88 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  37.98 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  39.52 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  39.84 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  40.62 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  36.72 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  37.4 
 
 		 287 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  40.62 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  38.93 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  40.32 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  37.69 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  35.11 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3311  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000971087  hitchhiker  0.0000356017 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  37.69 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  40.62 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  41.44 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6641  hypothetical protein  44.94 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  33.08 
 
 		 289 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  33.08 
 
 		 289 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  38.76 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  36.15 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  42.59 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  40.54 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  42.06 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  39.06 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  38.28 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3843  alpha/beta hydrolase fold  36.3 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  39.84 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>