More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6641 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6641  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  288  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  65.56 
 
 		 317 aa  124  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  52.27 
 
 		 323 aa  100  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  53.66 
 
 		 323 aa  92  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  46.23 
 
 		 315 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  46.51 
 
 		 315 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  49.43 
 
 		 324 aa  91.3  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  52.17 
 
 		 297 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  52.22 
 
 		 323 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  46.51 
 
 		 315 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  51.16 
 
 		 293 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  51.95 
 
 		 350 aa  87.4  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  39.38 
 
 		 308 aa  85.1  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  51.81 
 
 		 292 aa  84.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  51.72 
 
 		 344 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  66.1 
 
 		 299 aa  84  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  44.33 
 
 		 291 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  47.44 
 
 		 283 aa  83.6  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  43.14 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  53.42 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  46.67 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  54.69 
 
 		 311 aa  82  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  51.28 
 
 		 322 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 304 aa  81.3  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  58.06 
 
 		 308 aa  81.3  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  62.71 
 
 		 494 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  58.06 
 
 		 301 aa  80.9  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  45.68 
 
 		 308 aa  80.9  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  46.15 
 
 		 341 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  38.53 
 
 		 287 aa  78.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  50.68 
 
 		 302 aa  78.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  58.06 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 		 312 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2842  alpha/beta hydrolase fold  46.07 
 
 		 434 aa  77.8  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  52 
 
 		 351 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9230  epoxide hydrolase  44.94 
 
 		 371 aa  77.8  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.247355  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  43.75 
 
 		 337 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  46.15 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  46.15 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3309  alpha/beta hydrolase fold  45 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244903  hitchhiker  0.0000365568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  52 
 
 		 323 aa  75.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5525  alpha/beta hydrolase fold  44.94 
 
 		 367 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6398  alpha/beta hydrolase fold  44.94 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.234405 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5889  alpha/beta hydrolase fold  44.94 
 
 		 367 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159226  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  56.25 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  53.12 
 
 		 313 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  58.73 
 
 		 288 aa  75.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 311 aa  74.7  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  53.97 
 
 		 308 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  38.68 
 
 		 291 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  57.35 
 
 		 330 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  43.01 
 
 		 288 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  38.68 
 
 		 291 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  46.84 
 
 		 301 aa  74.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  39.25 
 
 		 314 aa  73.9  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3311  alpha/beta hydrolase fold  48.68 
 
 		 351 aa  74.3  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000971087  hitchhiker  0.0000356017 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  49.32 
 
 		 307 aa  73.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  48.48 
 
 		 291 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  48.48 
 
 		 291 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  41.94 
 
 		 288 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1398  hypothetical protein  64.15 
 
 		 210 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000123271  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  45.98 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6110  alpha/beta hydrolase fold  43.82 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173305  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0276  alpha/beta hydrolase fold  43.82 
 
 		 434 aa  72.8  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  34.67 
 
 		 349 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  46.97 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  41.57 
 
 		 287 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  42.7 
 
 		 287 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  48 
 
 		 300 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  51.52 
 
 		 331 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  34.93 
 
 		 310 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  48.65 
 
 		 334 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  45.98 
 
 		 308 aa  71.2  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5871  alpha/beta hydrolase fold  43.82 
 
 		 376 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  58.06 
 
 		 356 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3248  EphC  52.17 
 
 		 300 aa  70.9  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5947  alpha/beta hydrolase fold  59.32 
 
 		 390 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00350915 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 		 270 aa  70.5  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  34.93 
 
 		 310 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.96 
 
 		 293 aa  70.1  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0495  alpha/beta hydrolase fold protein  59.62 
 
 		 345 aa  68.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  48.61 
 
 		 328 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  44.71 
 
 		 300 aa  67.8  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  72.73 
 
 		 294 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0515  alpha/beta hydrolase fold  65.91 
 
 		 343 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  72.73 
 
 		 307 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7125  putative epoxide hydrolase  58.93 
 
 		 356 aa  67  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.675745  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  41.98 
 
 		 273 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0418  alpha/beta hydrolase fold  57.41 
 
 		 305 aa  67  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0502159  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  43.59 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  42.67 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  38.68 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  34.94 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  50.65 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 331 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  46.27 
 
 		 286 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 287 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  36.25 
 
 		 265 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  44.93 
 
 		 287 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>