More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1398 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1398  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  434  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000123271  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  74 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  72 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  68.63 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  68.63 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  65.38 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  73.47 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  66.67 
 
 		 341 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  62.5 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  62.9 
 
 		 311 aa  78.2  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  67.35 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0515  alpha/beta hydrolase fold  65.52 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  48.61 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  48.68 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  69.39 
 
 		 312 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  62.26 
 
 		 314 aa  75.1  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  61.54 
 
 		 315 aa  74.7  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6641  hypothetical protein  52.7 
 
 		 144 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  43.75 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  46.25 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0495  alpha/beta hydrolase fold protein  36.73 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  56.67 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  63.27 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  53.33 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  51.61 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  52.63 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  51.52 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  44.94 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  43.06 
 
 		 308 aa  67  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  57.14 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  61.22 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  54.39 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  57.41 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  55.56 
 
 		 350 aa  65.1  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  46.97 
 
 		 328 aa  65.1  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  53.62 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3309  alpha/beta hydrolase fold  52.63 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244903  hitchhiker  0.0000365568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  58.33 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  66.67 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  51.47 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  51.47 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  63.27 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  52.05 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  54.9 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  43.06 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  72.5 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  72.5 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7125  putative epoxide hydrolase  69.23 
 
 		 356 aa  62  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.675745  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  61.7 
 
 		 289 aa  62  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  68.29 
 
 		 356 aa  62  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 288 aa  62  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  58.18 
 
 		 288 aa  62  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  45.83 
 
 		 273 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  50.63 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2842  alpha/beta hydrolase fold  62.79 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0276  alpha/beta hydrolase fold  54.17 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  66 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  42.25 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  42.25 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6398  alpha/beta hydrolase fold  62.79 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.234405 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  59.57 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5525  alpha/beta hydrolase fold  62.79 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  49.15 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5889  alpha/beta hydrolase fold  62.79 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159226  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  43.24 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  58 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  53.7 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  61.7 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  53.85 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  53.57 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  53.85 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5947  alpha/beta hydrolase fold  56.25 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00350915 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6110  alpha/beta hydrolase fold  52.83 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173305  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9230  epoxide hydrolase  60.53 
 
 		 371 aa  58.9  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.247355  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  47.46 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5871  alpha/beta hydrolase fold  52.83 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  42.19 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  53.7 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  42.19 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  46.55 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  46.55 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3165  bromoperoxidase  46.55 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230592  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  41.43 
 
 		 278 aa  57  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  46.55 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  55.32 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  53.19 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3158  bromoperoxidase  46.55 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00429075  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3311  alpha/beta hydrolase fold  45.07 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000971087  hitchhiker  0.0000356017 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2090  bromoperoxidase  46.55 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3150  bromoperoxidase  46.55 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.908823  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  42.25 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  48.21 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  39.73 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  45 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  39.44 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>