More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4002 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  87.29 
 
 
356 aa  635    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
351 aa  717    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  70.64 
 
 
344 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  44.57 
 
 
350 aa  292  6e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  41.43 
 
 
330 aa  248  8e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  40.45 
 
 
317 aa  233  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  39.15 
 
 
323 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  37.93 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  37.07 
 
 
322 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  38.04 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  37.97 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  33.05 
 
 
324 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  35.63 
 
 
315 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  36.52 
 
 
323 aa  192  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  36.13 
 
 
308 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  38.44 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  35.47 
 
 
312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  34.3 
 
 
337 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 
341 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  34.37 
 
 
315 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  34.37 
 
 
315 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3843  alpha/beta hydrolase fold  35.07 
 
 
316 aa  169  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
323 aa  166  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  35.52 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3309  alpha/beta hydrolase fold  34.1 
 
 
321 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244903  hitchhiker  0.0000365568 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  31.61 
 
 
314 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  31.73 
 
 
328 aa  149  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 
315 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 
287 aa  146  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  30.17 
 
 
284 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5947  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00350915 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6110  alpha/beta hydrolase fold  32.61 
 
 
376 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173305  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 
331 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  30.35 
 
 
334 aa  136  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5871  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 
376 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 
331 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  44.31 
 
 
307 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6398  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.234405 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5525  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5889  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159226  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0495  alpha/beta hydrolase fold protein  32.13 
 
 
345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0276  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 
434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9230  epoxide hydrolase  30.48 
 
 
371 aa  126  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.247355  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2842  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 
434 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3311  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 
351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000971087  hitchhiker  0.0000356017 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0515  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 
343 aa  125  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  42.64 
 
 
290 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  51.64 
 
 
308 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  56.19 
 
 
289 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7125  putative epoxide hydrolase  32.48 
 
 
356 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.675745  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  42.37 
 
 
304 aa  122  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 
286 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  52.59 
 
 
283 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  50.41 
 
 
293 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 
308 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  49.21 
 
 
301 aa  119  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  48.46 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  53.85 
 
 
308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  49.59 
 
 
328 aa  116  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  48.41 
 
 
308 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  41.86 
 
 
289 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  41.86 
 
 
289 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  43.66 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  48.78 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  29.19 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  49.19 
 
 
301 aa  114  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  40.11 
 
 
349 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  51.82 
 
 
299 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 
303 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  44.29 
 
 
308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.12 
 
 
313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  44.88 
 
 
288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  46.34 
 
 
494 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 
323 aa  110  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  50.43 
 
 
304 aa  109  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  51.43 
 
 
287 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  51.75 
 
 
292 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  42.03 
 
 
307 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  42.52 
 
 
288 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  48.25 
 
 
291 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  41.73 
 
 
288 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  40.13 
 
 
291 aa  105  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  45.08 
 
 
311 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  36.72 
 
 
310 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 
305 aa  104  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  43.9 
 
 
294 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  43.88 
 
 
309 aa  102  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0438  alpha/beta hydrolase fold protein  42.64 
 
 
310 aa  100  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.207857 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  47.11 
 
 
294 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  43.85 
 
 
310 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  47.11 
 
 
307 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  35.03 
 
 
310 aa  99.8  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  45.22 
 
 
309 aa  99.8  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
290 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 
287 aa  99.4  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
300 aa  99  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  42.75 
 
 
270 aa  98.6  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  43.59 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  43.59 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>