More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0438 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0438  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 310 aa  627  1e-178  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.207857 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  51.84 
 
 		 310 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  55.74 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  44.04 
 
 		 309 aa  242  5e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  45.15 
 
 		 298 aa  225  6e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.681258  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  43.39 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  39 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  40.78 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  39.05 
 
 		 311 aa  196  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  38.74 
 
 		 308 aa  197  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0418  alpha/beta hydrolase fold  39.74 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0502159  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  37 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  38.87 
 
 		 494 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  36.22 
 
 		 349 aa  182  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  36.61 
 
 		 304 aa  179  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  35.83 
 
 		 307 aa  179  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  36.07 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  35.95 
 
 		 308 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  36.72 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  35.2 
 
 		 311 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.29 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  35.46 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5429  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4812  alpha/beta hydrolase fold  35.2 
 
 		 317 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.744056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4898  alpha/beta hydrolase fold  35.2 
 
 		 317 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451029  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5199  alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0800557  hitchhiker  0.000578485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1377  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.2117  normal  0.107315 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13701  epoxide hydrolase ephE  34.57 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0688152 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  31.54 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  30.67 
 
 		 303 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  33.72 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  31.77 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 		 287 aa  116  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  27.53 
 
 		 289 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  27.53 
 
 		 289 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  31.49 
 
 		 288 aa  109  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 287 aa  105  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 		 291 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 		 291 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  32.07 
 
 		 283 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 		 291 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  31.9 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 291 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 		 337 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  42.64 
 
 		 351 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  27.18 
 
 		 290 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 287 aa  99  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  32.76 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  29.97 
 
 		 300 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 304 aa  96.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  42.31 
 
 		 356 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  41.09 
 
 		 344 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  32.99 
 
 		 294 aa  95.9  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  41.41 
 
 		 331 aa  95.9  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 288 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  31.74 
 
 		 288 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  29.05 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  34.47 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 287 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 		 308 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 291 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  29.75 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  27.13 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  41.94 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 		 288 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 328 aa  89.7  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  27.24 
 
 		 315 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  32.44 
 
 		 297 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 		 317 aa  89  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  40.48 
 
 		 350 aa  89  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  28.3 
 
 		 330 aa  89  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 331 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 		 341 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 		 289 aa  87  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  29.47 
 
 		 302 aa  86.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  29.77 
 
 		 323 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0495  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 		 345 aa  85.9  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 		 288 aa  85.9  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 315 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 315 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 		 300 aa  85.9  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>