More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0418 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0418  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 305 aa  583  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0502159  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  56.48 
 
 		 494 aa  293  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  54 
 
 		 301 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  52.67 
 
 		 307 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  51.94 
 
 		 308 aa  285  9e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  51.34 
 
 		 308 aa  280  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  52.7 
 
 		 304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  49.16 
 
 		 311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  52.49 
 
 		 349 aa  268  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  51.95 
 
 		 308 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  51.77 
 
 		 313 aa  261  8e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  52.3 
 
 		 309 aa  258  8e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  49.17 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  51.32 
 
 		 310 aa  252  5.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  45.64 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  51.16 
 
 		 298 aa  243  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.681258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  46.3 
 
 		 307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  50.99 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  45.28 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5429  alpha/beta hydrolase fold  44.65 
 
 		 319 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  43.61 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  45.25 
 
 		 310 aa  223  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5199  alpha/beta hydrolase fold  44.16 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0800557  hitchhiker  0.000578485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1377  alpha/beta hydrolase fold  43.34 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.2117  normal  0.107315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4812  alpha/beta hydrolase fold  44.16 
 
 		 317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.744056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4898  alpha/beta hydrolase fold  44.16 
 
 		 317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451029  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  43.45 
 
 		 322 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13701  epoxide hydrolase ephE  41.93 
 
 		 327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0688152 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0438  alpha/beta hydrolase fold protein  39.74 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.207857 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  44.91 
 
 		 270 aa  195  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  35.76 
 
 		 301 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  32.39 
 
 		 303 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  29.05 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  30.72 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 286 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 		 287 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 289 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  26.76 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 289 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  37.93 
 
 		 297 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  35.11 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  37.82 
 
 		 270 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  33.85 
 
 		 323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  34.8 
 
 		 288 aa  119  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  32.93 
 
 		 324 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  33.8 
 
 		 308 aa  115  8.999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  40.57 
 
 		 307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  32.97 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  39.64 
 
 		 294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  32.7 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  51.64 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  45.8 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  32.67 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  35.04 
 
 		 287 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  33.44 
 
 		 330 aa  108  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  34.9 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 289 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  29.87 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 		 305 aa  105  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  45.04 
 
 		 351 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  36.7 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  32.65 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  31.88 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  35.93 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49570  predicted protein  28.48 
 
 		 326 aa  101  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  34.14 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  33.82 
 
 		 274 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  32.4 
 
 		 292 aa  99.4  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 		 297 aa  99.4  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  30.48 
 
 		 289 aa  99  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  32.42 
 
 		 323 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  30.51 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 		 273 aa  99  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.68 
 
 		 293 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  30.25 
 
 		 322 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 		 308 aa  95.9  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  41.32 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  42.96 
 
 		 356 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 		 276 aa  94  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 		 291 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  30.9 
 
 		 298 aa  93.6  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 		 312 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 323 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>