More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0511 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 311 aa  634    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  60.65 
 
 		 322 aa  388  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5429  alpha/beta hydrolase fold  59.24 
 
 		 319 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1377  alpha/beta hydrolase fold  58.79 
 
 		 319 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.2117  normal  0.107315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5199  alpha/beta hydrolase fold  56.45 
 
 		 317 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0800557  hitchhiker  0.000578485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4812  alpha/beta hydrolase fold  55.81 
 
 		 317 aa  348  9e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.744056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4898  alpha/beta hydrolase fold  55.81 
 
 		 317 aa  348  9e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451029  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13701  epoxide hydrolase ephE  54.06 
 
 		 327 aa  343  2e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0688152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  51.63 
 
 		 308 aa  306  4.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  50 
 
 		 313 aa  285  7e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  48.01 
 
 		 308 aa  264  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  46.38 
 
 		 301 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  46.08 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  48.01 
 
 		 307 aa  257  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  47.64 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  45.9 
 
 		 304 aa  247  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  46.36 
 
 		 349 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  44.55 
 
 		 308 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  45.25 
 
 		 310 aa  239  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  44.07 
 
 		 299 aa  238  9e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  45.36 
 
 		 494 aa  226  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  43.61 
 
 		 310 aa  225  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  41.53 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0418  alpha/beta hydrolase fold  43.61 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0502159  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  39.81 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.681258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  40.68 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  37.62 
 
 		 310 aa  186  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  38.56 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0438  alpha/beta hydrolase fold protein  35.2 
 
 		 310 aa  167  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.207857 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.06 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  34.92 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  35.25 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  31.44 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 		 289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 		 284 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  39.8 
 
 		 294 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 287 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  39.8 
 
 		 307 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  34.68 
 
 		 301 aa  125  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  33.55 
 
 		 291 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  32.52 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  34.12 
 
 		 297 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  43.37 
 
 		 270 aa  112  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 		 283 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  32.44 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  34.05 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  27.81 
 
 		 311 aa  105  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  32.13 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  40.59 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  28.85 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  24.84 
 
 		 309 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  30.64 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  30.64 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  30.84 
 
 		 297 aa  102  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  32.66 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  31.47 
 
 		 289 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 		 287 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  32.32 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  50.88 
 
 		 350 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.3 
 
 		 293 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 287 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 		 306 aa  96.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 		 287 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  38.2 
 
 		 317 aa  96.3  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 315 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49570  predicted protein  40.71 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  28.76 
 
 		 288 aa  94.4  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  26.75 
 
 		 334 aa  92.8  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 		 283 aa  92.8  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 282 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  40.62 
 
 		 344 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  39.87 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 313 aa  91.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 		 330 aa  92.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  43.31 
 
 		 351 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  28.71 
 
 		 322 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 		 291 aa  90.5  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 		 328 aa  90.1  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  31.42 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>