More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7125 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7125  putative epoxide hydrolase  100 
 
 		 356 aa  741    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.675745  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6110  alpha/beta hydrolase fold  57.46 
 
 		 376 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173305  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5871  alpha/beta hydrolase fold  56.55 
 
 		 376 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5525  alpha/beta hydrolase fold  58.03 
 
 		 367 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5889  alpha/beta hydrolase fold  58.03 
 
 		 367 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159226  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6398  alpha/beta hydrolase fold  57.18 
 
 		 367 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.234405 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9230  epoxide hydrolase  54.93 
 
 		 371 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.247355  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2842  alpha/beta hydrolase fold  57.18 
 
 		 434 aa  375  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5947  alpha/beta hydrolase fold  53.91 
 
 		 390 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00350915 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0276  alpha/beta hydrolase fold  54.47 
 
 		 434 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  32.3 
 
 		 312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.24 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 		 337 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  33.52 
 
 		 351 aa  135  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  34.01 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  31.82 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  32.69 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  31.1 
 
 		 315 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  30.5 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 		 344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  31.86 
 
 		 330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  33.7 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  32.32 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  28.65 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  30.34 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 		 324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  31.49 
 
 		 323 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  30.66 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0515  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  27.22 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 		 328 aa  99.4  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  25.07 
 
 		 323 aa  90.1  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 		 331 aa  89.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  43.22 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3843  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 		 316 aa  87  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  40.98 
 
 		 283 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0495  alpha/beta hydrolase fold protein  26.9 
 
 		 345 aa  85.9  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  42.2 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  39.02 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3309  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244903  hitchhiker  0.0000365568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  40.16 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  42.59 
 
 		 301 aa  82.4  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  44.63 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  39.34 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  48.62 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  48.62 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  41.8 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  44.17 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  39.34 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  39.34 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  40.16 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  44.63 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  40.54 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  45.08 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  39.29 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  42.62 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  38.52 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  41.46 
 
 		 494 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  40.19 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  44.44 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3311  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000971087  hitchhiker  0.0000356017 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  44.25 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  41.8 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11147  epoxide hydrolase ephC  37.86 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05183  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14860)  23.78 
 
 		 780 aa  73.6  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  42.06 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  37.61 
 
 		 287 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  43.44 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  43.44 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  40.37 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  42.45 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  37.5 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4086  alpha/beta hydrolase fold  38.98 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4162  alpha/beta hydrolase fold  38.98 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.573182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4316  alpha/beta hydrolase fold  38.98 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  42.62 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  38.94 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  40.16 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  42.62 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0191  alpha/beta hydrolase fold  34.84 
 
 		 303 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  39.82 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  38.39 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  39.29 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.06 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  38.66 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6641  hypothetical protein  58.93 
 
 		 144 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  38.66 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>