More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0515 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0515  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
343 aa  706    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  48.68 
 
 
328 aa  310  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  47.63 
 
 
331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  48.66 
 
 
334 aa  305  7e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  45.86 
 
 
331 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  43.33 
 
 
323 aa  276  5e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  40.6 
 
 
322 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  34.32 
 
 
323 aa  202  7e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  37.31 
 
 
311 aa  199  6e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  35.24 
 
 
314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  39.58 
 
 
317 aa  189  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  33.74 
 
 
315 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  37.08 
 
 
315 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  37.08 
 
 
315 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  34.56 
 
 
312 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  35.87 
 
 
341 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  35.28 
 
 
337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  33.13 
 
 
315 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  33.82 
 
 
315 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  34.23 
 
 
323 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 
315 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  34.55 
 
 
302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  33.55 
 
 
324 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0495  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 
345 aa  145  7.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  35.06 
 
 
323 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
308 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  33.63 
 
 
323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3843  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 
316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  32.44 
 
 
297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  34.44 
 
 
330 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
344 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  30.54 
 
 
291 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 
351 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 
300 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
287 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
304 aa  116  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  29.36 
 
 
288 aa  115  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  29.79 
 
 
356 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  27.99 
 
 
288 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  30.89 
 
 
289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 
288 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  29.22 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 
292 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  28.23 
 
 
283 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 
301 aa  110  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
288 aa  109  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  27.45 
 
 
328 aa  109  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 
287 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
304 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
286 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
284 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3309  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
321 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244903  hitchhiker  0.0000365568 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9230  epoxide hydrolase  28.22 
 
 
371 aa  105  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.247355  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 
287 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 
287 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  28.71 
 
 
308 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3311  alpha/beta hydrolase fold  30.84 
 
 
351 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000971087  hitchhiker  0.0000356017 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  24.4 
 
 
289 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  24.4 
 
 
289 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
291 aa  102  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  31.73 
 
 
300 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  27.74 
 
 
311 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  29.15 
 
 
295 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 
308 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  24.38 
 
 
290 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5947  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 
390 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00350915 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  28.8 
 
 
308 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
305 aa  99.4  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2842  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
434 aa  99  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5525  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
367 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5889  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
367 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159226  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
308 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 
303 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6110  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 
376 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173305  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5871  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 
376 aa  96.7  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 
308 aa  96.3  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25.52 
 
 
350 aa  96.3  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6398  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
367 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.234405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7125  putative epoxide hydrolase  27.41 
 
 
356 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.675745  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 
307 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 
287 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07292  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16900)  26.64 
 
 
381 aa  93.2  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.29567 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
313 aa  92.8  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  26.73 
 
 
305 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  30.1 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 
307 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
270 aa  89.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 
299 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05183  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14860)  25.38 
 
 
780 aa  88.6  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  27.3 
 
 
273 aa  88.2  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 
349 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
291 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>