More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4229 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4229  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 328 aa  651    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  39.33 
 
 		 288 aa  169  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  38.93 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  39.02 
 
 		 277 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4242  alpha/beta hydrolase fold protein  38.79 
 
 		 271 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.992424  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  38.43 
 
 		 309 aa  152  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 273 aa  150  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  35.04 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5124  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 272 aa  136  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6199  alpha/beta hydrolase fold protein  35.09 
 
 		 296 aa  132  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82135  normal  0.298395 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  38 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  37.37 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.15 
 
 		 278 aa  129  8.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  35.45 
 
 		 281 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  35.66 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  33.95 
 
 		 291 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  36.43 
 
 		 287 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  32.4 
 
 		 287 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  32.62 
 
 		 291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 		 288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  32.95 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  32.46 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  32.95 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  32.95 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  32.95 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  32.95 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  32.95 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  34.97 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1694  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 		 277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0287329  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  30.69 
 
 		 296 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0485  alpha/beta hydrolase fold  35.98 
 
 		 284 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.891583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0496  alpha/beta hydrolase fold  35.98 
 
 		 284 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0507  alpha/beta hydrolase fold  35.98 
 
 		 284 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.697131 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  34.83 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.6 
 
 		 293 aa  99.8  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  28.33 
 
 		 301 aa  99  9e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3859  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 		 278 aa  95.9  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  30.1 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 287 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 		 290 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 288 aa  90.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 		 308 aa  90.5  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  32.16 
 
 		 494 aa  90.1  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 		 287 aa  89.7  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 		 303 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  28 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  25.94 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  28.52 
 
 		 295 aa  86.3  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 297 aa  85.9  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 		 270 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  30.34 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  26.49 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  31.52 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  30.54 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  26.49 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  29.04 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  28.89 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 308 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  36.5 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  28.86 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0418  alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0502159  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.27 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  43.56 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  27.93 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  31.5 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  34.76 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  38.84 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  38.84 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  43 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0519  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  26.49 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>