More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2250 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 315 aa  621  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  48.29 
 
 		 596 aa  249  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  46.74 
 
 		 340 aa  249  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  48.11 
 
 		 596 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  48.11 
 
 		 596 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  46.88 
 
 		 602 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  48.11 
 
 		 596 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  46.88 
 
 		 602 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  46.76 
 
 		 590 aa  245  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1796  short chain dehydrogenase  47.22 
 
 		 590 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.24 
 
 		 602 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  46.08 
 
 		 595 aa  235  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  45.73 
 
 		 618 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  46.08 
 
 		 595 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1384  alpha/beta hydrolase fold  48.96 
 
 		 320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  45.73 
 
 		 595 aa  232  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  46.46 
 
 		 595 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  46.46 
 
 		 595 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  46.46 
 
 		 595 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  45.52 
 
 		 592 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3548  alpha/beta hydrolase fold  44.69 
 
 		 293 aa  222  4.9999999999999996e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.26 
 
 		 588 aa  217  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4650  alpha/beta hydrolase fold protein  44.73 
 
 		 342 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0286073 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4518  alpha/beta hydrolase fold  44.73 
 
 		 342 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0590754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  47.42 
 
 		 568 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1142  Alpha/beta hydrolase  45.02 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3691  alpha/beta hydrolase fold  44.13 
 
 		 312 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4677  alpha/beta hydrolase fold  44.13 
 
 		 312 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246976  normal  0.206505 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5623  alpha/beta hydrolase fold  43.77 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4529  alpha/beta hydrolase fold  44.69 
 
 		 311 aa  205  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.190868 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4071  alpha/beta hydrolase fold  45.42 
 
 		 310 aa  205  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4016  alpha/beta hydrolase fold  43.34 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459613  normal  0.722956 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2355  alpha/beta fold family hydrolase  41.31 
 
 		 345 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110523  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4876  alpha/beta hydrolase fold  44.56 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000503768  normal  0.514103 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1474  alpha/beta fold family hydrolase  43.46 
 
 		 316 aa  192  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1792  putative hydrolase  43.49 
 
 		 316 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000565691 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0561  EphD  43.46 
 
 		 317 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.284331  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1344  alpha/beta fold family hydrolase  43.46 
 
 		 317 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2522  alpha/beta fold family hydrolase  43.46 
 
 		 317 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1006  alpha/beta fold family hydrolase  43.46 
 
 		 317 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1267  alpha/beta fold family hydrolase  43.46 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  40.88 
 
 		 592 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  42.14 
 
 		 588 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  42.14 
 
 		 588 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  42.14 
 
 		 588 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1140  alpha/beta fold family hydrolase  39.44 
 
 		 308 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1132  alpha/beta fold family hydrolase  39.44 
 
 		 308 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.366992  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2203  alpha/beta fold family hydrolase  39.44 
 
 		 308 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1296  alpha/beta fold family hydrolase  39.44 
 
 		 308 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0689  alpha/beta fold family hydrolase  39.44 
 
 		 308 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2091  alpha/beta fold family hydrolase  39.44 
 
 		 308 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0476  alpha/beta hydrolase fold protein  42.12 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2521  alpha/beta fold family hydrolase  39.44 
 
 		 750 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3576  short chain dehydrogenase  35.96 
 
 		 538 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129186  normal  0.037556 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2937  short chain dehydrogenase  50.69 
 
 		 543 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5601  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988839 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 		 301 aa  99  9e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  34.4 
 
 		 277 aa  99  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 288 aa  99  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 274 aa  97.1  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 		 281 aa  96.3  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 		 289 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 		 291 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  32.31 
 
 		 273 aa  93.2  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  24.32 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  38.78 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  38.26 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  23.16 
 
 		 290 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  38.26 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  23.99 
 
 		 289 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  38.78 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  38.78 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  38.78 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  38.78 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  29.35 
 
 		 289 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 287 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  29.85 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  34.97 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  32.38 
 
 		 281 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  23.31 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 297 aa  85.9  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  35.12 
 
 		 308 aa  85.9  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3189  alpha/beta hydrolase  27.04 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0982  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.48 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1129  alpha/beta hydrolase fold protein  27.3 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  35.06 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  31.53 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0770  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  25.62 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>