More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3311 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  66.5 
 
 		 592 aa  770    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 588 aa  1180    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 588 aa  1180    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 588 aa  1180    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2937  short chain dehydrogenase  54.58 
 
 		 543 aa  568  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3576  short chain dehydrogenase  56.3 
 
 		 538 aa  561  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129186  normal  0.037556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.08 
 
 		 602 aa  463  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  41.75 
 
 		 602 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  41.64 
 
 		 602 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  41.27 
 
 		 590 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  42.73 
 
 		 595 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 		 595 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  42.38 
 
 		 595 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  42.38 
 
 		 595 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  42.38 
 
 		 595 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  41.68 
 
 		 618 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  41.86 
 
 		 595 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 		 588 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  39.83 
 
 		 592 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1796  short chain dehydrogenase  39.83 
 
 		 590 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  41.9 
 
 		 596 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  41.9 
 
 		 596 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  41.9 
 
 		 596 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  43.52 
 
 		 568 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  41.45 
 
 		 596 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  40.27 
 
 		 340 aa  208  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  42.14 
 
 		 315 aa  204  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1384  alpha/beta hydrolase fold  39.16 
 
 		 320 aa  195  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3548  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 		 293 aa  176  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4650  alpha/beta hydrolase fold protein  37.76 
 
 		 342 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0286073 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4518  alpha/beta hydrolase fold  37.76 
 
 		 342 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0590754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2355  alpha/beta fold family hydrolase  36.15 
 
 		 345 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110523  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5623  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 312 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1142  Alpha/beta hydrolase  34.84 
 
 		 307 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3691  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 312 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4677  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 312 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246976  normal  0.206505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.62 
 
 		 267 aa  158  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4529  alpha/beta hydrolase fold  34.26 
 
 		 311 aa  156  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.190868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 		 279 aa  155  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4016  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 		 303 aa  154  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459613  normal  0.722956 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 273 aa  152  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0626824  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4071  alpha/beta hydrolase fold  35.27 
 
 		 310 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2521  alpha/beta fold family hydrolase  35.67 
 
 		 750 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1344  alpha/beta fold family hydrolase  37 
 
 		 317 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1006  alpha/beta fold family hydrolase  37 
 
 		 317 aa  151  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36915  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2522  alpha/beta fold family hydrolase  37 
 
 		 317 aa  151  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0561  EphD  37 
 
 		 317 aa  151  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.284331  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2091  alpha/beta fold family hydrolase  35.45 
 
 		 308 aa  151  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1140  alpha/beta fold family hydrolase  35.45 
 
 		 308 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1474  alpha/beta fold family hydrolase  36.46 
 
 		 316 aa  150  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2203  alpha/beta fold family hydrolase  35.45 
 
 		 308 aa  150  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1296  alpha/beta fold family hydrolase  35.45 
 
 		 308 aa  150  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1132  alpha/beta fold family hydrolase  35.45 
 
 		 308 aa  150  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.366992  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0689  alpha/beta fold family hydrolase  35.45 
 
 		 308 aa  150  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1267  alpha/beta fold family hydrolase  36.63 
 
 		 317 aa  150  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.83 
 
 		 275 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  41.03 
 
 		 294 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  40.51 
 
 		 271 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.81 
 
 		 296 aa  143  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 		 295 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4106  short chain dehydrogenase  39.8 
 
 		 295 aa  141  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 		 282 aa  140  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  41.06 
 
 		 292 aa  140  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.3 
 
 		 285 aa  140  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1792  putative hydrolase  34.25 
 
 		 316 aa  139  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000565691 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  41.45 
 
 		 270 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  32.35 
 
 		 295 aa  136  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 269 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 289 aa  136  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4876  alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 		 321 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000503768  normal  0.514103 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 281 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 296 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 		 273 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  39.49 
 
 		 271 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 296 aa  134  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0880635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 309 aa  134  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  39.49 
 
 		 269 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 		 280 aa  133  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0817481  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.65 
 
 		 278 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.41 
 
 		 275 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.08 
 
 		 284 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.08 
 
 		 284 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  38.97 
 
 		 269 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.08 
 
 		 284 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.95 
 
 		 276 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  31.93 
 
 		 295 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 278 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1844  short chain dehydrogenase  38.12 
 
 		 270 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  39.06 
 
 		 270 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5157  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 		 271 aa  130  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.3 
 
 		 275 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2823  short chain dehydrogenase  34.17 
 
 		 292 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00207351  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 		 278 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  35.12 
 
 		 275 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  29.58 
 
 		 273 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 271 aa  129  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11893  short chain dehydrogenase  38.07 
 
 		 286 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.361469 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  35.57 
 
 		 276 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0476  alpha/beta hydrolase fold protein  34.65 
 
 		 298 aa  129  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.18 
 
 		 252 aa  128  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>