More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2937 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2937  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 543 aa  1078    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3576  short chain dehydrogenase  70.35 
 
 		 538 aa  682    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129186  normal  0.037556 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  55 
 
 		 592 aa  593  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  54.91 
 
 		 588 aa  554  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  54.91 
 
 		 588 aa  554  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  54.91 
 
 		 588 aa  554  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  39.83 
 
 		 590 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 		 602 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1796  short chain dehydrogenase  38.28 
 
 		 590 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  37.37 
 
 		 602 aa  356  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  42.71 
 
 		 568 aa  355  8.999999999999999e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  37.46 
 
 		 602 aa  355  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  37.97 
 
 		 592 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  38.04 
 
 		 595 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  38.53 
 
 		 618 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  39.1 
 
 		 595 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 588 aa  330  3e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  37.67 
 
 		 595 aa  330  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 		 596 aa  329  6e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  38.45 
 
 		 595 aa  329  9e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  38.45 
 
 		 595 aa  329  9e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  38.45 
 
 		 595 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 		 596 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 		 596 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 		 596 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  37.31 
 
 		 295 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  37.31 
 
 		 295 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 		 275 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 		 295 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  36.65 
 
 		 340 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 		 279 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1384  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 		 320 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.55 
 
 		 267 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  40.84 
 
 		 271 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4106  short chain dehydrogenase  32.3 
 
 		 295 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  40.84 
 
 		 270 aa  138  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.16 
 
 		 309 aa  139  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  39.47 
 
 		 294 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5157  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 271 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 		 278 aa  137  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 		 296 aa  137  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0880635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 		 296 aa  136  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 270 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  38.95 
 
 		 271 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1844  short chain dehydrogenase  40.43 
 
 		 270 aa  135  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 		 278 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  36.45 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 		 251 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  37.89 
 
 		 269 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  38.42 
 
 		 269 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 296 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  37.89 
 
 		 269 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  36.22 
 
 		 273 aa  130  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.03 
 
 		 252 aa  130  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 		 282 aa  130  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  36.79 
 
 		 276 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 		 263 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 273 aa  128  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0626824  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.48 
 
 		 281 aa  128  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 276 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 		 267 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 		 278 aa  126  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000841338  hitchhiker  0.00141318 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3548  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 		 275 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 		 280 aa  125  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 		 271 aa  124  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 		 275 aa  123  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 		 242 aa  123  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01992  short chain dehydrogenase  28.72 
 
 		 276 aa  123  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000620206  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1472  short chain dehydrogenase  34.57 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 		 269 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2524  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 		 308 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1346  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.46 
 
 		 308 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  35.1 
 
 		 292 aa  121  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  36.56 
 
 		 242 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1008  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 		 308 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.388516  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 308 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 308 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0827865  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1269  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.46 
 
 		 308 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.42 
 
 		 280 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 		 275 aa  120  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00962961  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 300 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.680577 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0404  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 		 302 aa  120  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.81 
 
 		 264 aa  120  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0960385  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2355  alpha/beta fold family hydrolase  44 
 
 		 345 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110523  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.14 
 
 		 289 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1820  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 		 267 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 250 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.69 
 
 		 284 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 		 300 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514987 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5623  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 		 312 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2443  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 300 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.82 
 
 		 252 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.69 
 
 		 284 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 312 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169146  normal  0.55969 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.49 
 
 		 278 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2823  short chain dehydrogenase  32.03 
 
 		 292 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00207351  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.69 
 
 		 308 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  hitchhiker  0.00146118 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.69 
 
 		 284 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4313  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 		 290 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>