More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3649 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  68.6 
 
 
602 aa  845    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  77.68 
 
 
596 aa  959    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  94.29 
 
 
595 aa  1145    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  77.68 
 
 
596 aa  959    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  78.52 
 
 
596 aa  971    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  100 
 
 
595 aa  1201    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  69.1 
 
 
602 aa  849    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  94.12 
 
 
595 aa  1140    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  91.43 
 
 
595 aa  1113    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  92.61 
 
 
618 aa  1127    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  94.12 
 
 
595 aa  1140    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  77.68 
 
 
596 aa  959    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  93.95 
 
 
595 aa  1138    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1796  short chain dehydrogenase  51.78 
 
 
590 aa  599  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  51.26 
 
 
592 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  47.81 
 
 
590 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.82 
 
 
602 aa  445  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  46.38 
 
 
568 aa  430  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.59 
 
 
588 aa  414  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  40.56 
 
 
592 aa  392  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 
588 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 
588 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 
588 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1384  alpha/beta hydrolase fold  53.92 
 
 
320 aa  323  5e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  49.03 
 
 
340 aa  296  7e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3576  short chain dehydrogenase  36.91 
 
 
538 aa  296  8e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129186  normal  0.037556 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4650  alpha/beta hydrolase fold protein  51.11 
 
 
342 aa  286  9e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0286073 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4518  alpha/beta hydrolase fold  51.11 
 
 
342 aa  286  9e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0590754  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1474  alpha/beta fold family hydrolase  47.04 
 
 
316 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1344  alpha/beta fold family hydrolase  45.65 
 
 
317 aa  264  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1006  alpha/beta fold family hydrolase  45.65 
 
 
317 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36915  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2522  alpha/beta fold family hydrolase  45.65 
 
 
317 aa  263  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0561  EphD  45.65 
 
 
317 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.284331  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1267  alpha/beta fold family hydrolase  45.34 
 
 
317 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4876  alpha/beta hydrolase fold  47.78 
 
 
321 aa  262  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000503768  normal  0.514103 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3548  alpha/beta hydrolase fold  49.64 
 
 
293 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1142  Alpha/beta hydrolase  46.25 
 
 
307 aa  257  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4016  alpha/beta hydrolase fold  48.24 
 
 
303 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459613  normal  0.722956 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4529  alpha/beta hydrolase fold  46.71 
 
 
311 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.190868 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3691  alpha/beta hydrolase fold  46.71 
 
 
312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4677  alpha/beta hydrolase fold  46.71 
 
 
312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246976  normal  0.206505 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5623  alpha/beta hydrolase fold  46.71 
 
 
312 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4071  alpha/beta hydrolase fold  47.18 
 
 
310 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1792  putative hydrolase  48.3 
 
 
316 aa  246  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000565691 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  46.08 
 
 
315 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2937  short chain dehydrogenase  42.41 
 
 
543 aa  224  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1140  alpha/beta fold family hydrolase  41.9 
 
 
308 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2203  alpha/beta fold family hydrolase  41.9 
 
 
308 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1296  alpha/beta fold family hydrolase  41.9 
 
 
308 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2091  alpha/beta fold family hydrolase  41.9 
 
 
308 aa  189  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0689  alpha/beta fold family hydrolase  41.9 
 
 
308 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1132  alpha/beta fold family hydrolase  41.9 
 
 
308 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.366992  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2521  alpha/beta fold family hydrolase  41.9 
 
 
750 aa  187  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2355  alpha/beta fold family hydrolase  43.02 
 
 
345 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110523  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 
275 aa  153  8e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0476  alpha/beta hydrolase fold protein  37.2 
 
 
298 aa  152  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
267 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
282 aa  144  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  43.52 
 
 
292 aa  141  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.53 
 
 
278 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
279 aa  140  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 
284 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 
284 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 
284 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
278 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
278 aa  138  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.99 
 
 
295 aa  137  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  30.53 
 
 
273 aa  136  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  31.25 
 
 
295 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2681  short chain dehydrogenase family protein  30.53 
 
 
273 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  30.51 
 
 
295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.96 
 
 
277 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1810  short chain dehydrogenase  35.52 
 
 
285 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1857  short chain dehydrogenase  35.52 
 
 
285 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1791  short chain dehydrogenase  35.52 
 
 
285 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146977  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1784  hypothetical protein  35.29 
 
 
305 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
263 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2914  hypothetical protein  40.55 
 
 
301 aa  129  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  41.29 
 
 
301 aa  128  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1700  hypothetical protein  38.15 
 
 
301 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2003  hypothetical protein  38.15 
 
 
301 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122286  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.11 
 
 
276 aa  127  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.83 
 
 
285 aa  127  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  34.45 
 
 
275 aa  127  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
280 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.370364  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11271  short-chain type dehydrogenase/reductase  33.7 
 
 
276 aa  126  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000317139  hitchhiker  0.0033897 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3975  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
276 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
276 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171067  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
275 aa  126  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0241632 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
276 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13074  short chain dehydrogenase  32.97 
 
 
287 aa  125  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.486367 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2561  hypothetical protein  35.52 
 
 
301 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.226357  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  37.55 
 
 
265 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4313  short chain dehydrogenase  35.04 
 
 
290 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
273 aa  124  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0626824  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 
308 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  hitchhiker  0.00146118 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
309 aa  124  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 
275 aa  124  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0404  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.21 
 
 
302 aa  124  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
252 aa  124  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>