More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5364 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 267 aa  539  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  44.98 
 
 		 269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  44.98 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  44.98 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  43.37 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  43.37 
 
 		 271 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  44.58 
 
 		 271 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4106  short chain dehydrogenase  43.6 
 
 		 295 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  44.18 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  40.94 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 		 284 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 		 284 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 		 284 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  43.37 
 
 		 270 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.19 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 		 278 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1844  short chain dehydrogenase  43.37 
 
 		 270 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 		 278 aa  191  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.87 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  36.26 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01992  short chain dehydrogenase  34.9 
 
 		 276 aa  172  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000620206  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1917  short chain dehydrogenase  38.34 
 
 		 275 aa  168  8e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  41.39 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 590 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 		 278 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2681  short chain dehydrogenase family protein  34.35 
 
 		 273 aa  159  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 		 279 aa  158  9e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  33.97 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  45.92 
 
 		 588 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  45.92 
 
 		 588 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.58 
 
 		 271 aa  155  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  45.92 
 
 		 588 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  37.74 
 
 		 292 aa  155  9e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0404  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.06 
 
 		 302 aa  155  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0101  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.06 
 
 		 302 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1074  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.06 
 
 		 302 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2443  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2673  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.06 
 
 		 302 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2820  dehydrogenases with different specificities  36.06 
 
 		 302 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1262  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.06 
 
 		 302 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514987 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1539  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.96 
 
 		 302 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0120  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.96 
 
 		 302 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 		 300 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  39.62 
 
 		 295 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 		 300 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0817481  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2868  hypothetical protein  37.69 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 		 275 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 		 595 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 		 602 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.09 
 
 		 300 aa  149  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.680577 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  36.03 
 
 		 275 aa  148  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  37.93 
 
 		 596 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  38.02 
 
 		 595 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  37.93 
 
 		 596 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  38.02 
 
 		 595 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  38.02 
 
 		 595 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  37.93 
 
 		 596 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  41.33 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  37.26 
 
 		 596 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  34.94 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6766  putative short-chain dehydrogenase  34.85 
 
 		 279 aa  146  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  40.84 
 
 		 295 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  38.02 
 
 		 595 aa  145  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 		 296 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2914  hypothetical protein  39.52 
 
 		 301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1846  hypothetical protein  34.44 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.09 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0626824  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1784  hypothetical protein  36.55 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  43.78 
 
 		 602 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0880635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 		 296 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  43.92 
 
 		 568 aa  142  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  hitchhiker  0.00146118 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2003  hypothetical protein  36.8 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122286  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1700  hypothetical protein  36.8 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 		 347 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  36.54 
 
 		 602 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 		 595 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 		 618 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 277 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 		 285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 		 312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169146  normal  0.55969 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.58 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 		 293 aa  139  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.26 
 
 		 298 aa  138  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.99 
 
 		 184 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.396312  normal  0.215379 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1769  hypothetical protein  38.83 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657278  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1538  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:glucose/ribitol dehydrogenase  39.51 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0217494  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300242  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1472  short chain dehydrogenase  34.73 
 
 		 315 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>