More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1917 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1917  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 275 aa  560  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  53.01 
 
 		 273 aa  280  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  43.35 
 
 		 276 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 		 278 aa  230  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01992  short chain dehydrogenase  42.19 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000620206  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  44.11 
 
 		 270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  44.85 
 
 		 269 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 		 269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1844  short chain dehydrogenase  43.73 
 
 		 270 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  41.8 
 
 		 271 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  42.19 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  43.85 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  42.8 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4106  short chain dehydrogenase  40.84 
 
 		 295 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  42.59 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 275 aa  169  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 		 284 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 		 284 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 		 284 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 		 278 aa  149  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1769  hypothetical protein  40.8 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657278  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 		 278 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1846  hypothetical protein  40.91 
 
 		 300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  40.8 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2714  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.27 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.199953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1415  hypothetical protein  40.2 
 
 		 300 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1478  hypothetical protein  33.6 
 
 		 300 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.520899  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1437  hypothetical protein  33.99 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0211064 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  30.13 
 
 		 273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2681  short chain dehydrogenase family protein  28.92 
 
 		 273 aa  136  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.67 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.62 
 
 		 278 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000841338  hitchhiker  0.00141318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  33.72 
 
 		 265 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  32.86 
 
 		 295 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2914  hypothetical protein  33.73 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  32.21 
 
 		 596 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.57 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300242  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1934  hypothetical protein  36.63 
 
 		 300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0777827  normal  0.376049 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.85 
 
 		 274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.85 
 
 		 274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.879856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  32.21 
 
 		 596 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  32.21 
 
 		 596 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  32.21 
 
 		 596 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2868  hypothetical protein  35.29 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.48 
 
 		 274 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2561  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  128  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.226357  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  36.62 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.63 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 		 275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0241632 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  32.16 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2003  hypothetical protein  33.98 
 
 		 301 aa  126  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122286  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1784  hypothetical protein  32.43 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2268  hypothetical protein  33.46 
 
 		 304 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484059  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1700  hypothetical protein  33.98 
 
 		 301 aa  126  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2488  hypothetical protein  37.81 
 
 		 304 aa  125  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.18 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.24 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347777 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 		 275 aa  123  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 		 184 aa  122  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0319  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  37.57 
 
 		 247 aa  122  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0139781  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.42 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.06 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2833  hypothetical protein  33.46 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  29.8 
 
 		 590 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 		 249 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2823  short chain dehydrogenase  30.88 
 
 		 292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00207351  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4091  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.85 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 		 281 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255746 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02266  putative 3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.33 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2816  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.45 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689066  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.218017  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3807  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.428856  normal  0.173588 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7331  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.29 
 
 		 249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 		 255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.01 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 		 250 aa  119  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 256 aa  118  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 		 247 aa  118  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.56 
 
 		 347 aa  118  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.883232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>