More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01992 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01992  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 276 aa  574  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000620206  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  47.25 
 
 		 276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  43.33 
 
 		 273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1917  short chain dehydrogenase  42.19 
 
 		 275 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  38.52 
 
 		 269 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  38.13 
 
 		 271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  37.74 
 
 		 269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  37.92 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4106  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  38.13 
 
 		 271 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  38.52 
 
 		 294 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  37.35 
 
 		 269 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  36.72 
 
 		 270 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1844  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 		 270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 		 267 aa  172  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2681  short chain dehydrogenase family protein  33.2 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  32.8 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1934  hypothetical protein  32.95 
 
 		 300 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0777827  normal  0.376049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.92 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000841338  hitchhiker  0.00141318 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  32.54 
 
 		 289 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1415  hypothetical protein  29.43 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2488  hypothetical protein  31.64 
 
 		 304 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1846  hypothetical protein  30.5 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2268  hypothetical protein  32.21 
 
 		 304 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484059  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1769  hypothetical protein  29.08 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657278  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00920  short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  34.39 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1784  hypothetical protein  30.86 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2914  hypothetical protein  30.47 
 
 		 301 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.930868  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  30.86 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2561  hypothetical protein  30.47 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.226357  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1437  hypothetical protein  29.79 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0211064 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 		 273 aa  130  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0626824  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  30.08 
 
 		 275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 285 aa  129  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  30.89 
 
 		 265 aa  128  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  29.62 
 
 		 590 aa  128  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.5 
 
 		 280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300242  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1478  hypothetical protein  29.43 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.520899  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2868  hypothetical protein  30.08 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 		 279 aa  125  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  34.74 
 
 		 253 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 		 261 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 		 271 aa  126  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.664099  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  37.31 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2447  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.98 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.115187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.5 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 		 309 aa  123  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1700  hypothetical protein  30.35 
 
 		 301 aa  123  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2003  hypothetical protein  30.35 
 
 		 301 aa  123  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122286  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.31 
 
 		 275 aa  123  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0241632 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.26 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12680  short chain dehydrogenase  27.78 
 
 		 278 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2714  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 		 294 aa  122  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.199953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  31.13 
 
 		 281 aa  122  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2833  hypothetical protein  29.34 
 
 		 309 aa  122  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.22 
 
 		 255 aa  122  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.836966 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.22 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  33.68 
 
 		 253 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  30.86 
 
 		 596 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  30.86 
 
 		 596 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  30.86 
 
 		 596 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.64 
 
 		 284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.64 
 
 		 284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.64 
 
 		 284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  32.9 
 
 		 847 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 290 aa  119  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 		 266 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 250 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  32.63 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2351  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.8 
 
 		 252 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.647461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3545  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 		 273 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 		 251 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  32.63 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  30.45 
 
 		 596 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.09 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  31.47 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3663  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 		 270 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712953  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  29.17 
 
 		 253 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  33.16 
 
 		 253 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  28.25 
 
 		 595 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  31.98 
 
 		 295 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>