More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2174 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 596 aa  1199    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 596 aa  1199    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  76.85 
 
 		 595 aa  952    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  79.03 
 
 		 595 aa  968    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  96.98 
 
 		 596 aa  1170    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  66.83 
 
 		 602 aa  819    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  77.68 
 
 		 595 aa  959    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  79.19 
 
 		 595 aa  971    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  79.19 
 
 		 595 aa  972    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 596 aa  1199    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  76.85 
 
 		 618 aa  952    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  79.19 
 
 		 595 aa  972    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  66.67 
 
 		 602 aa  819    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  50.42 
 
 		 592 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1796  short chain dehydrogenase  50.76 
 
 		 590 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  48.69 
 
 		 590 aa  519  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.91 
 
 		 602 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  46.68 
 
 		 568 aa  426  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 		 588 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  39.17 
 
 		 592 aa  375  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  41.9 
 
 		 588 aa  363  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  41.9 
 
 		 588 aa  363  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  41.9 
 
 		 588 aa  363  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1384  alpha/beta hydrolase fold  54.58 
 
 		 320 aa  332  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2937  short chain dehydrogenase  37.99 
 
 		 543 aa  312  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  49.84 
 
 		 340 aa  297  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3576  short chain dehydrogenase  36.35 
 
 		 538 aa  282  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129186  normal  0.037556 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4518  alpha/beta hydrolase fold  48.57 
 
 		 342 aa  281  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0590754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4650  alpha/beta hydrolase fold protein  48.57 
 
 		 342 aa  281  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0286073 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3548  alpha/beta hydrolase fold  49.08 
 
 		 293 aa  264  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1474  alpha/beta fold family hydrolase  44.27 
 
 		 316 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4876  alpha/beta hydrolase fold  46.84 
 
 		 321 aa  257  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000503768  normal  0.514103 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2522  alpha/beta fold family hydrolase  43.29 
 
 		 317 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0561  EphD  43.29 
 
 		 317 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.284331  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1006  alpha/beta fold family hydrolase  43.29 
 
 		 317 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36915  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1344  alpha/beta fold family hydrolase  43.29 
 
 		 317 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1142  Alpha/beta hydrolase  45.54 
 
 		 307 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1267  alpha/beta fold family hydrolase  43.29 
 
 		 317 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5623  alpha/beta hydrolase fold  47.06 
 
 		 312 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3691  alpha/beta hydrolase fold  47.06 
 
 		 312 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4677  alpha/beta hydrolase fold  47.06 
 
 		 312 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246976  normal  0.206505 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4529  alpha/beta hydrolase fold  47.06 
 
 		 311 aa  252  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.190868 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4071  alpha/beta hydrolase fold  48.39 
 
 		 310 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  48.11 
 
 		 315 aa  248  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4016  alpha/beta hydrolase fold  45.77 
 
 		 303 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459613  normal  0.722956 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1792  putative hydrolase  47.14 
 
 		 316 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000565691 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1132  alpha/beta fold family hydrolase  37.79 
 
 		 308 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.366992  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2203  alpha/beta fold family hydrolase  37.79 
 
 		 308 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1140  alpha/beta fold family hydrolase  37.79 
 
 		 308 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2521  alpha/beta fold family hydrolase  37.54 
 
 		 750 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1296  alpha/beta fold family hydrolase  37.79 
 
 		 308 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2091  alpha/beta fold family hydrolase  37.79 
 
 		 308 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0689  alpha/beta fold family hydrolase  37.79 
 
 		 308 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2355  alpha/beta fold family hydrolase  41.38 
 
 		 345 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110523  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.28 
 
 		 275 aa  170  6e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0476  alpha/beta hydrolase fold protein  38.49 
 
 		 298 aa  159  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 282 aa  150  9e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 		 278 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 		 267 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13074  short chain dehydrogenase  35.96 
 
 		 287 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.486367 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.35 
 
 		 284 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.35 
 
 		 284 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.35 
 
 		 284 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 278 aa  140  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 		 295 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  29.23 
 
 		 273 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  42.71 
 
 		 292 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2681  short chain dehydrogenase family protein  28.85 
 
 		 273 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  32.72 
 
 		 295 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 		 278 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.53 
 
 		 249 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 		 263 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  31.41 
 
 		 295 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 		 279 aa  131  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  33.98 
 
 		 273 aa  130  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2914  hypothetical protein  41 
 
 		 301 aa  130  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2561  hypothetical protein  40.91 
 
 		 301 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.226357  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  41 
 
 		 301 aa  129  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 		 300 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13102  short-chain type dehydrogenase/reductase  34.75 
 
 		 276 aa  127  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.432292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 		 308 aa  127  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  hitchhiker  0.00146118 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1810  short chain dehydrogenase  34.47 
 
 		 285 aa  127  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1857  short chain dehydrogenase  34.47 
 
 		 285 aa  127  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 		 300 aa  126  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2868  hypothetical protein  42.13 
 
 		 301 aa  126  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 		 300 aa  126  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 275 aa  126  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0241632 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1700  hypothetical protein  37.35 
 
 		 301 aa  126  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2003  hypothetical protein  37.35 
 
 		 301 aa  126  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122286  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 300 aa  126  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.680577 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 		 275 aa  126  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 		 280 aa  126  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1791  short chain dehydrogenase  34.47 
 
 		 285 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2443  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 300 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 309 aa  125  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  28.95 
 
 		 276 aa  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 		 308 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4313  short chain dehydrogenase  32.97 
 
 		 290 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 		 285 aa  124  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 276 aa  125  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>