More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3699 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
280 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0817481  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13102  short-chain type dehydrogenase/reductase  57.66 
 
 
276 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.432292  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.47 
 
 
276 aa  308  5e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.04 
 
 
276 aa  305  7e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.01 
 
 
276 aa  301  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171067  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3975  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.01 
 
 
276 aa  301  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.01 
 
 
276 aa  301  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11271  short-chain type dehydrogenase/reductase  54.38 
 
 
276 aa  301  1e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000317139  hitchhiker  0.0033897 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.65 
 
 
276 aa  297  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.28 
 
 
271 aa  286  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.35 
 
 
295 aa  264  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.37 
 
 
275 aa  262  6e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.14 
 
 
275 aa  261  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00962961  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  45.58 
 
 
295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  45.94 
 
 
295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0404  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  51.12 
 
 
302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.27 
 
 
296 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.55 
 
 
279 aa  252  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2673  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  50.75 
 
 
302 aa  251  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2820  dehydrogenases with different specificities  50.75 
 
 
302 aa  251  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1074  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  50.75 
 
 
302 aa  251  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0120  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  50.75 
 
 
302 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1539  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  50.75 
 
 
302 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0101  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  50.75 
 
 
302 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1262  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  50.75 
 
 
302 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.44 
 
 
282 aa  246  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.27 
 
 
278 aa  245  6e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.34 
 
 
311 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2443  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.35 
 
 
300 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 
300 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.680577 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.99 
 
 
300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.514987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1144  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 
307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151567  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.99 
 
 
300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.99 
 
 
300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.99 
 
 
281 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.64 
 
 
308 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  hitchhiker  0.00146118 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.64 
 
 
308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.49 
 
 
309 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.396312  normal  0.215379 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.49 
 
 
309 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.13 
 
 
309 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.84 
 
 
296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0880635  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.48 
 
 
296 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1472  short chain dehydrogenase  45.62 
 
 
315 aa  239  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.39 
 
 
308 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0827865  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2524  short chain dehydrogenase  45.39 
 
 
308 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1008  short chain dehydrogenase  45.39 
 
 
308 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.388516  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1269  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.39 
 
 
308 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1346  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.39 
 
 
308 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.76 
 
 
312 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.65 
 
 
312 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169146  normal  0.55969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6766  putative short-chain dehydrogenase  45.19 
 
 
279 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.52 
 
 
302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176242  normal  0.778008 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1790  short chain dehydrogenase  45.58 
 
 
307 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000125648 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5157  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.56 
 
 
271 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.65 
 
 
309 aa  209  5e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.074209  normal  0.817715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.59 
 
 
273 aa  202  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.172953  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.13 
 
 
273 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.42 
 
 
286 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.252629  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.61 
 
 
275 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.15 
 
 
274 aa  185  8e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.239905  normal  0.858139 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.13 
 
 
321 aa  183  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13478  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.07 
 
 
282 aa  181  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.78 
 
 
274 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
274 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.169711  normal  0.0760952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.19 
 
 
269 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00185291  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13074  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 
287 aa  160  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.486367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.7 
 
 
281 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2034  short chain dehydrogenase  36.2 
 
 
290 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4313  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 
290 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
267 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.319176  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 
313 aa  156  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.638785  decreased coverage  0.00000422955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1810  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 
285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1857  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 
285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1791  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 
285 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146977  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.25 
 
 
277 aa  155  8e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.248176  normal  0.05597 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
275 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  39.82 
 
 
292 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2823  short chain dehydrogenase  32.51 
 
 
292 aa  152  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00207351  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.64 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0836216  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.75 
 
 
262 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.75 
 
 
262 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 
262 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.948025  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
267 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
273 aa  148  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00031135 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  39.56 
 
 
294 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  36.5 
 
 
590 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2840  short chain dehydrogenase  35.36 
 
 
302 aa  143  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28747  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
309 aa  143  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
267 aa  142  8e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2714  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.199953  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  40.1 
 
 
271 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 
269 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.685444  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  39.55 
 
 
270 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  41.18 
 
 
289 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1844  short chain dehydrogenase  37.86 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  37.73 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
278 aa  133  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  39.32 
 
 
269 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  39.23 
 
 
271 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  39.05 
 
 
269 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.246181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>