More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1087 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
286 aa  558  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.252629  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.7 
 
 
281 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.17 
 
 
273 aa  252  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.63 
 
 
278 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5157  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.91 
 
 
271 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.33 
 
 
279 aa  236  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.56 
 
 
274 aa  235  7e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.169711  normal  0.0760952 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.18 
 
 
274 aa  234  9e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.239905  normal  0.858139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.81 
 
 
274 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.85 
 
 
273 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00031135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6766  putative short-chain dehydrogenase  46.27 
 
 
279 aa  231  9e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 
281 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.47 
 
 
282 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.62 
 
 
296 aa  222  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0880635  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1269  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.39 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2524  short chain dehydrogenase  45.39 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1472  short chain dehydrogenase  45.39 
 
 
315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1008  short chain dehydrogenase  45.39 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.388516  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.26 
 
 
296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.39 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0827865  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1346  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.39 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.69 
 
 
273 aa  218  7e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.172953  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.11 
 
 
312 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169146  normal  0.55969 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1144  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 
307 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151567  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 
309 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1790  short chain dehydrogenase  44.68 
 
 
307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000125648 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.17 
 
 
311 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.61 
 
 
309 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.396312  normal  0.215379 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.61 
 
 
309 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 
302 aa  208  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176242  normal  0.778008 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.06 
 
 
275 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00962961  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
312 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.61 
 
 
275 aa  202  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  42.01 
 
 
295 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  41.54 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.54 
 
 
295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.65 
 
 
300 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.514987 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.65 
 
 
300 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.65 
 
 
300 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.91 
 
 
300 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.680577 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.65 
 
 
308 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.65 
 
 
308 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  hitchhiker  0.00146118 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2443  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.65 
 
 
300 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.66 
 
 
321 aa  191  8e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13478  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11271  short-chain type dehydrogenase/reductase  41.39 
 
 
276 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000317139  hitchhiker  0.0033897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.53 
 
 
276 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.42 
 
 
280 aa  189  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0817481  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1074  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.5 
 
 
302 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2673  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.5 
 
 
302 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2820  dehydrogenases with different specificities  41.5 
 
 
302 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
276 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171067  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0120  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.16 
 
 
302 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
276 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3975  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
276 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
276 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1539  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.16 
 
 
302 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0101  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.16 
 
 
302 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.29 
 
 
309 aa  186  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.074209  normal  0.817715 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1262  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.16 
 
 
302 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0404  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.45 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 
269 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00185291  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.81 
 
 
276 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13102  short-chain type dehydrogenase/reductase  40.6 
 
 
276 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.432292  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.72 
 
 
313 aa  176  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.638785  decreased coverage  0.00000422955 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.55 
 
 
277 aa  170  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.248176  normal  0.05597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.03 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.64 
 
 
282 aa  163  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
267 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.319176  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
269 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.685444  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 
275 aa  143  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.07 
 
 
267 aa  142  8e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03130  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  35.9 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
262 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.948025  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
262 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 
276 aa  136  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
262 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
276 aa  135  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0836216  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3168  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 
270 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.273274  normal  0.685188 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2951  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1414  short chain dehydrogenase  38.08 
 
 
270 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.68 
 
 
264 aa  125  9e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2823  short chain dehydrogenase  32.69 
 
 
292 aa  122  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00207351  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3021  short chain dehydrogenase  35.61 
 
 
268 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.98 
 
 
266 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.871012  hitchhiker  0.000000000383418 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3311  short chain dehydrogenase  34.59 
 
 
268 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0701949  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4313  short chain dehydrogenase  32.42 
 
 
290 aa  118  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2711  short chain dehydrogenase  33.84 
 
 
268 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.84 
 
 
272 aa  116  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333155 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  30.32 
 
 
264 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.56 
 
 
322 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3041  short chain dehydrogenase  33.84 
 
 
268 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631041  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.85 
 
 
264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.38 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  30.32 
 
 
264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  30.32 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.32 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.32 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.67 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.416641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>