More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2356 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
282 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.25 
 
 
276 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.01 
 
 
295 aa  263  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13102  short-chain type dehydrogenase/reductase  50.35 
 
 
276 aa  260  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.432292  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11271  short-chain type dehydrogenase/reductase  49.46 
 
 
276 aa  257  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000317139  hitchhiker  0.0033897 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.83 
 
 
276 aa  250  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
275 aa  249  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00962961  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.71 
 
 
271 aa  249  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.01 
 
 
276 aa  248  7e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  49.63 
 
 
295 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.62 
 
 
276 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171067  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3975  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.62 
 
 
276 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.44 
 
 
280 aa  246  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0817481  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.62 
 
 
276 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.19 
 
 
275 aa  247  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  47.41 
 
 
295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.1 
 
 
279 aa  226  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
278 aa  221  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2443  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.48 
 
 
300 aa  218  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0101  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.04 
 
 
302 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1262  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.04 
 
 
302 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2820  dehydrogenases with different specificities  46.43 
 
 
302 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2673  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.43 
 
 
302 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1074  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.43 
 
 
302 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1539  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.43 
 
 
302 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0120  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.43 
 
 
302 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0404  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.43 
 
 
302 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.76 
 
 
300 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.514987 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1472  short chain dehydrogenase  44.96 
 
 
315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.76 
 
 
300 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.76 
 
 
300 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1144  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 
307 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151567  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.59 
 
 
311 aa  215  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1008  short chain dehydrogenase  45.32 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.388516  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2524  short chain dehydrogenase  45.32 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1346  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.32 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.32 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0827865  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1269  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.32 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.99 
 
 
300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.680577 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.12 
 
 
312 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
312 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169146  normal  0.55969 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.12 
 
 
309 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.12 
 
 
309 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.396312  normal  0.215379 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.68 
 
 
308 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.5 
 
 
296 aa  208  9e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
309 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.32 
 
 
308 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  hitchhiker  0.00146118 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.5 
 
 
296 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0880635  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5157  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.82 
 
 
271 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
309 aa  202  4e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.074209  normal  0.817715 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.81 
 
 
302 aa  201  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176242  normal  0.778008 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6766  putative short-chain dehydrogenase  45.74 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.65 
 
 
281 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1790  short chain dehydrogenase  41.75 
 
 
307 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000125648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.96 
 
 
275 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 
273 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.172953  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.32 
 
 
274 aa  166  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.239905  normal  0.858139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.96 
 
 
274 aa  161  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.58 
 
 
276 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0836216  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.64 
 
 
286 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.252629  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.49 
 
 
277 aa  160  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.248176  normal  0.05597 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  38.21 
 
 
292 aa  155  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.22 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.169711  normal  0.0760952 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  39.25 
 
 
596 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.18 
 
 
261 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.07 
 
 
269 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00185291  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
269 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.685444  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 
596 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 
596 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 
596 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.319176  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 
595 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 
595 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.03 
 
 
247 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 
595 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 
595 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.05 
 
 
282 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  39.15 
 
 
592 aa  142  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 
595 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  38.15 
 
 
618 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16655  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.51 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  38.78 
 
 
568 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1796  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 
590 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  37.41 
 
 
595 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.82 
 
 
241 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  42.93 
 
 
289 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.75 
 
 
276 aa  135  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  40.96 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13074  short chain dehydrogenase  36.88 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.486367 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  40.83 
 
 
588 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 
592 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  40.83 
 
 
588 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  40.83 
 
 
588 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.89 
 
 
261 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.3 
 
 
267 aa  133  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.59 
 
 
275 aa  132  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>