More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4313 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4313  short chain dehydrogenase  100 
 
 
290 aa  584  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2034  short chain dehydrogenase  84.83 
 
 
290 aa  501  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1791  short chain dehydrogenase  79.3 
 
 
285 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146977  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1810  short chain dehydrogenase  79.65 
 
 
285 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1857  short chain dehydrogenase  79.65 
 
 
285 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13074  short chain dehydrogenase  76.49 
 
 
287 aa  450  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.486367 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.26 
 
 
309 aa  314  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2823  short chain dehydrogenase  55.64 
 
 
292 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00207351  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.24 
 
 
318 aa  291  7e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2840  short chain dehydrogenase  53.23 
 
 
302 aa  255  5e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28747  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
279 aa  179  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6766  putative short-chain dehydrogenase  39.31 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13102  short-chain type dehydrogenase/reductase  36.64 
 
 
276 aa  158  9e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.432292  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 
280 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0817481  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.88 
 
 
278 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  hitchhiker  0.00146118 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2443  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.41 
 
 
300 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 
300 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.514987 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  36.6 
 
 
568 aa  146  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 
300 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 
300 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
281 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.58 
 
 
300 aa  142  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.680577 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
275 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 
273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.172953  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
296 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 
296 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0880635  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1346  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.57 
 
 
308 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 
312 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169146  normal  0.55969 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2524  short chain dehydrogenase  34.57 
 
 
308 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1008  short chain dehydrogenase  34.57 
 
 
308 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.388516  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 
590 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
308 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0827865  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1269  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.57 
 
 
308 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 
286 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.930868  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.396312  normal  0.215379 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
309 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
311 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 
312 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1144  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.71 
 
 
307 aa  135  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151567  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 
276 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1472  short chain dehydrogenase  34.2 
 
 
315 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0404  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.07 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11271  short-chain type dehydrogenase/reductase  31.67 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000317139  hitchhiker  0.0033897 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0101  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 
302 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0120  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 
302 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1539  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 
302 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1262  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 
302 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 
263 aa  133  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.22 
 
 
296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.22 
 
 
275 aa  133  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00962961  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1074  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.58 
 
 
302 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2820  dehydrogenases with different specificities  33.58 
 
 
302 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2673  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.58 
 
 
302 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  39.18 
 
 
265 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0155651  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  33.1 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 
271 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 
280 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
282 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
276 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
281 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255746 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.85 
 
 
276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  32.76 
 
 
295 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
321 aa  129  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13478  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 
286 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 
618 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  34.91 
 
 
595 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 
595 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  34.55 
 
 
595 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  34.91 
 
 
595 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  34.91 
 
 
595 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3975  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
276 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
282 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
276 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171067  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
276 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.08 
 
 
246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1796  short chain dehydrogenase  33.98 
 
 
590 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  31.32 
 
 
276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
310 aa  126  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.190304  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
274 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
274 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.879856  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  35.04 
 
 
595 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  32.97 
 
 
596 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  32.97 
 
 
596 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  32.97 
 
 
596 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
302 aa  125  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176242  normal  0.778008 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
273 aa  125  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  40.39 
 
 
275 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1790  short chain dehydrogenase  32.84 
 
 
307 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000125648 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.55 
 
 
278 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>