More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2317 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
263 aa  521  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  70.11 
 
 
265 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.42 
 
 
275 aa  322  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.24 
 
 
298 aa  266  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.38 
 
 
274 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.38 
 
 
274 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.38 
 
 
274 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.879856  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.19 
 
 
280 aa  226  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.94 
 
 
285 aa  226  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.81 
 
 
275 aa  221  8e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0241632 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.13 
 
 
277 aa  218  7e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.19 
 
 
280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300242  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.19 
 
 
280 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4644  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.42 
 
 
279 aa  209  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.931829  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.64 
 
 
273 aa  207  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0626824  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  39.31 
 
 
273 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2681  short chain dehydrogenase family protein  38.76 
 
 
273 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.17 
 
 
286 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.37 
 
 
184 aa  170  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.448097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
267 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2397  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
284 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
278 aa  156  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.561593  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
272 aa  154  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 
275 aa  150  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01992  short chain dehydrogenase  33.85 
 
 
276 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000620206  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
273 aa  142  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.09 
 
 
278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  44.33 
 
 
270 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  39.21 
 
 
255 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
308 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
308 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  hitchhiker  0.00146118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
300 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  39.69 
 
 
595 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 
618 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
300 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.680577 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
300 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.514987 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  38.28 
 
 
568 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  35.79 
 
 
295 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4313  short chain dehydrogenase  34.69 
 
 
290 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2443  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
300 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  38.55 
 
 
595 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  38.55 
 
 
595 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 
267 aa  132  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15589  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13074  short chain dehydrogenase  35.57 
 
 
287 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.486367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
602 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  38.82 
 
 
596 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  38.82 
 
 
596 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  38.55 
 
 
595 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  38.82 
 
 
596 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.32 
 
 
246 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  38.55 
 
 
595 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.32 
 
 
246 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0101  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.42 
 
 
302 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0120  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.42 
 
 
302 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1539  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.42 
 
 
302 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1262  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.42 
 
 
302 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  38.08 
 
 
596 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2034  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  34.67 
 
 
247 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2820  dehydrogenases with different specificities  34.06 
 
 
302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2673  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.06 
 
 
302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1074  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.06 
 
 
302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1820  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  34.22 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4106  short chain dehydrogenase  32.56 
 
 
295 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  38.17 
 
 
595 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0404  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.7 
 
 
302 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2823  short chain dehydrogenase  32.84 
 
 
292 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00207351  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  35.63 
 
 
590 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1117  short chain dehydrogenase  39.81 
 
 
266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  39.6 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.5 
 
 
251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3541  short chain dehydrogenase  43.48 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100637  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  34.1 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.69 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.607483  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.29 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  34.32 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.95 
 
 
250 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
293 aa  126  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4481  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.36 
 
 
265 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643643  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  37.61 
 
 
253 aa  125  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11271  short-chain type dehydrogenase/reductase  36.64 
 
 
276 aa  125  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000317139  hitchhiker  0.0033897 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 
252 aa  125  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
246 aa  125  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.86 
 
 
260 aa  125  6e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000302146 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3009  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.56 
 
 
261 aa  125  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0803108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
233 aa  125  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
588 aa  125  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  39.91 
 
 
253 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1791  short chain dehydrogenase  34.69 
 
 
285 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146977  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  34.48 
 
 
269 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  39.2 
 
 
256 aa  124  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
284 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>