More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1796 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1796  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 590 aa  1196    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  95.44 
 
 		 592 aa  1142    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  52.2 
 
 		 595 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  52.53 
 
 		 595 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  52.53 
 
 		 595 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  51.95 
 
 		 618 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  52.53 
 
 		 595 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  51.95 
 
 		 595 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  51.78 
 
 		 595 aa  599  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  51.46 
 
 		 602 aa  588  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  50.76 
 
 		 596 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  50.76 
 
 		 596 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  50.76 
 
 		 596 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  51.13 
 
 		 602 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  50.08 
 
 		 596 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  46.18 
 
 		 590 aa  518  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.69 
 
 		 588 aa  471  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.71 
 
 		 602 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  47.08 
 
 		 568 aa  442  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  39.97 
 
 		 592 aa  398  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  39.83 
 
 		 588 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  39.83 
 
 		 588 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  39.83 
 
 		 588 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  62.29 
 
 		 340 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2937  short chain dehydrogenase  37.57 
 
 		 543 aa  330  4e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3576  short chain dehydrogenase  39.24 
 
 		 538 aa  318  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129186  normal  0.037556 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1384  alpha/beta hydrolase fold  49.37 
 
 		 320 aa  293  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4529  alpha/beta hydrolase fold  51.21 
 
 		 311 aa  279  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.190868 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3548  alpha/beta hydrolase fold  49.65 
 
 		 293 aa  277  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4016  alpha/beta hydrolase fold  50.87 
 
 		 303 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459613  normal  0.722956 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1142  Alpha/beta hydrolase  50.87 
 
 		 307 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4071  alpha/beta hydrolase fold  51.06 
 
 		 310 aa  273  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1474  alpha/beta fold family hydrolase  46.39 
 
 		 316 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5623  alpha/beta hydrolase fold  49.83 
 
 		 312 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3691  alpha/beta hydrolase fold  49.83 
 
 		 312 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4677  alpha/beta hydrolase fold  49.83 
 
 		 312 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246976  normal  0.206505 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1267  alpha/beta fold family hydrolase  45.94 
 
 		 317 aa  269  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1344  alpha/beta fold family hydrolase  45.62 
 
 		 317 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2522  alpha/beta fold family hydrolase  45.62 
 
 		 317 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1006  alpha/beta fold family hydrolase  45.62 
 
 		 317 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36915  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0561  EphD  45.62 
 
 		 317 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.284331  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4876  alpha/beta hydrolase fold  49.83 
 
 		 321 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000503768  normal  0.514103 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1792  putative hydrolase  49.16 
 
 		 316 aa  261  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000565691 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  47.22 
 
 		 315 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4650  alpha/beta hydrolase fold protein  43.56 
 
 		 342 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0286073 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4518  alpha/beta hydrolase fold  43.56 
 
 		 342 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0590754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2355  alpha/beta fold family hydrolase  40.07 
 
 		 345 aa  194  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2521  alpha/beta fold family hydrolase  36.71 
 
 		 750 aa  188  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0689  alpha/beta fold family hydrolase  36.89 
 
 		 308 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1140  alpha/beta fold family hydrolase  36.89 
 
 		 308 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1132  alpha/beta fold family hydrolase  36.89 
 
 		 308 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.366992  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2203  alpha/beta fold family hydrolase  36.89 
 
 		 308 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1296  alpha/beta fold family hydrolase  36.89 
 
 		 308 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2091  alpha/beta fold family hydrolase  36.89 
 
 		 308 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0476  alpha/beta hydrolase fold protein  36.91 
 
 		 298 aa  154  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 		 275 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 		 249 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 282 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 		 295 aa  135  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 		 279 aa  134  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  40.7 
 
 		 292 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 309 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 		 278 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 278 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13074  short chain dehydrogenase  33.45 
 
 		 287 aa  127  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.486367 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 		 284 aa  127  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 		 284 aa  127  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 		 284 aa  127  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4313  short chain dehydrogenase  33.98 
 
 		 290 aa  126  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2823  short chain dehydrogenase  31.06 
 
 		 292 aa  126  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00207351  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.31 
 
 		 275 aa  124  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00962961  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 		 280 aa  124  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0817481  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1810  short chain dehydrogenase  34 
 
 		 285 aa  124  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.57 
 
 		 278 aa  123  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000841338  hitchhiker  0.00141318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1857  short chain dehydrogenase  34 
 
 		 285 aa  124  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.93 
 
 		 275 aa  123  9e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1791  short chain dehydrogenase  34 
 
 		 285 aa  123  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2034  short chain dehydrogenase  32.67 
 
 		 290 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 		 275 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 		 280 aa  120  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.370364  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 		 280 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 		 276 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171067  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3975  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 		 276 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 		 276 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2833  hypothetical protein  36.22 
 
 		 309 aa  120  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6766  putative short-chain dehydrogenase  34.1 
 
 		 279 aa  120  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  32.96 
 
 		 301 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  29.29 
 
 		 295 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 		 285 aa  118  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 		 273 aa  118  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.172953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13102  short-chain type dehydrogenase/reductase  32.4 
 
 		 276 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.432292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 		 267 aa  117  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.98 
 
 		 276 aa  117  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2914  hypothetical protein  37.75 
 
 		 301 aa  116  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 		 258 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 289 aa  115  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.469183 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 		 318 aa  115  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2488  hypothetical protein  34.98 
 
 		 304 aa  115  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 		 275 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11271  short-chain type dehydrogenase/reductase  30.8 
 
 		 276 aa  114  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000317139  hitchhiker  0.0033897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>