More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A1008 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
308 aa  634    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0827865  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1008  short chain dehydrogenase  100 
 
 
308 aa  634    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.388516  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2524  short chain dehydrogenase  100 
 
 
308 aa  634    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1269  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  100 
 
 
308 aa  634    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1346  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  100 
 
 
308 aa  634    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1472  short chain dehydrogenase  92.06 
 
 
315 aa  577  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1144  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  83.82 
 
 
307 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151567  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  82.2 
 
 
309 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  81.88 
 
 
309 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  82.2 
 
 
309 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.396312  normal  0.215379 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  81.49 
 
 
312 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169146  normal  0.55969 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  81.67 
 
 
311 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.21 
 
 
312 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.53 
 
 
302 aa  461  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176242  normal  0.778008 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1790  short chain dehydrogenase  76.53 
 
 
307 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000125648 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.7 
 
 
296 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.36 
 
 
296 aa  424  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0880635  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.89 
 
 
296 aa  421  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  57.48 
 
 
295 aa  347  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.14 
 
 
295 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  57.48 
 
 
295 aa  345  4e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.24 
 
 
300 aa  305  7e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.680577 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.67 
 
 
300 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.514987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2443  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.33 
 
 
300 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.75 
 
 
308 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.3 
 
 
300 aa  301  9e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.3 
 
 
300 aa  301  9e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.39 
 
 
308 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  hitchhiker  0.00146118 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0101  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  53.9 
 
 
302 aa  299  4e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1262  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  53.9 
 
 
302 aa  299  4e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0120  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  53.9 
 
 
302 aa  298  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1539  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  53.9 
 
 
302 aa  298  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2820  dehydrogenases with different specificities  53.38 
 
 
302 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1074  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  53.38 
 
 
302 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2673  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  53.38 
 
 
302 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0404  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  54.95 
 
 
302 aa  286  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.66 
 
 
271 aa  278  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.3 
 
 
309 aa  277  1e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.074209  normal  0.817715 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.28 
 
 
278 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.96 
 
 
276 aa  256  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.3 
 
 
276 aa  256  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3975  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48 
 
 
276 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48 
 
 
276 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171067  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48 
 
 
276 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13102  short-chain type dehydrogenase/reductase  47.25 
 
 
276 aa  249  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.432292  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.3 
 
 
276 aa  247  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.32 
 
 
279 aa  246  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.35 
 
 
275 aa  244  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.39 
 
 
280 aa  238  6.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0817481  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.71 
 
 
275 aa  237  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00962961  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11271  short-chain type dehydrogenase/reductase  43.54 
 
 
276 aa  238  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000317139  hitchhiker  0.0033897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6766  putative short-chain dehydrogenase  45.26 
 
 
279 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.16 
 
 
281 aa  222  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5157  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.39 
 
 
286 aa  219  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.252629  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.3 
 
 
282 aa  216  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.28 
 
 
273 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.172953  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.77 
 
 
275 aa  199  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.54 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.02 
 
 
321 aa  187  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13478  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.42 
 
 
274 aa  177  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.169711  normal  0.0760952 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.37 
 
 
274 aa  176  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.239905  normal  0.858139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
281 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.59 
 
 
313 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.638785  decreased coverage  0.00000422955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 
322 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.56 
 
 
269 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00185291  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
277 aa  155  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.248176  normal  0.05597 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.53 
 
 
275 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
273 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00031135 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16655  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 
267 aa  144  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4618  putative short-chain dehydrogenase  33.79 
 
 
305 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100713 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.685444  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
267 aa  139  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.319176  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4313  short chain dehydrogenase  34.57 
 
 
290 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.45 
 
 
267 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03130  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  33.46 
 
 
275 aa  134  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.88 
 
 
276 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0836216  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2657  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.97 
 
 
322 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0750048 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2951  short chain dehydrogenase  32.73 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  38.12 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
309 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  36.49 
 
 
301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2714  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.19 
 
 
294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.199953  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2034  short chain dehydrogenase  33.82 
 
 
290 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.64 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333155 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.71 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.03 
 
 
285 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 
332 aa  126  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1844  short chain dehydrogenase  32.4 
 
 
270 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.16 
 
 
264 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  35.16 
 
 
264 aa  125  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  35.16 
 
 
264 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.16 
 
 
264 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  35.16 
 
 
264 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1791  short chain dehydrogenase  32.06 
 
 
285 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146977  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>