More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2215 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 276 aa  568  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01992  short chain dehydrogenase  47.25 
 
 		 276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000620206  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  44.02 
 
 		 273 aa  241  7.999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1917  short chain dehydrogenase  43.35 
 
 		 275 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  38.19 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  38.98 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  36.64 
 
 		 294 aa  205  6e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  39.29 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4106  short chain dehydrogenase  38.34 
 
 		 295 aa  202  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  39.53 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 		 269 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 		 278 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  38.72 
 
 		 270 aa  195  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1844  short chain dehydrogenase  37.88 
 
 		 270 aa  191  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 284 aa  158  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 284 aa  158  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 284 aa  158  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2681  short chain dehydrogenase family protein  33.2 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.96 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  32.6 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12680  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  31.48 
 
 		 592 aa  136  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  33.63 
 
 		 590 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.69 
 
 		 246 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1934  hypothetical protein  33.85 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0777827  normal  0.376049 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.53 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300242  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.42 
 
 		 273 aa  133  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0626824  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 		 278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.68 
 
 		 279 aa  132  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  35.44 
 
 		 295 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 		 286 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  32.3 
 
 		 265 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0224  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  34.53 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1791  short chain dehydrogenase  29.89 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.83 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1810  short chain dehydrogenase  29.89 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2868  hypothetical protein  33.2 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  33.33 
 
 		 289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1857  short chain dehydrogenase  29.89 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.45 
 
 		 256 aa  129  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  35.57 
 
 		 588 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  35.57 
 
 		 588 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  35.57 
 
 		 588 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 		 250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2561  hypothetical protein  32.94 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.226357  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  34.95 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2567  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.3 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4313  short chain dehydrogenase  31.32 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  35.08 
 
 		 596 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  35.64 
 
 		 275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13074  short chain dehydrogenase  31.44 
 
 		 287 aa  125  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.486367 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 		 281 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  28.95 
 
 		 596 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  28.95 
 
 		 596 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000760103 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  28.95 
 
 		 596 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 308 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  hitchhiker  0.00146118 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1784  hypothetical protein  31.64 
 
 		 305 aa  125  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.18 
 
 		 298 aa  125  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.01 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.33 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2488  hypothetical protein  32.94 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0101774  normal  0.961149 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0880635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2443  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.88 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00920  short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  35.03 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 		 252 aa  122  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2351  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.64 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.647461  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 309 aa  122  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 295 aa  122  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4948  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.31 
 
 		 250 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 		 296 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1846  hypothetical protein  31.01 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 602 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 		 293 aa  122  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3132  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.2 
 
 		 258 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0908587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  35.82 
 
 		 253 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 		 347 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.8 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.18 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.52 
 
 		 184 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  35.11 
 
 		 602 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.62 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.42 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3005  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.17 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.02 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.680577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>