More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1359 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  68.6 
 
 		 595 aa  845    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  66.67 
 
 		 596 aa  819    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  66.67 
 
 		 596 aa  819    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  69.44 
 
 		 595 aa  848    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 602 aa  1226    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  67 
 
 		 596 aa  826    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  66.78 
 
 		 595 aa  824    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  68.6 
 
 		 595 aa  837    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  96.68 
 
 		 602 aa  1187    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  66.78 
 
 		 618 aa  825    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  68.6 
 
 		 595 aa  837    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  68.6 
 
 		 595 aa  837    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  66.67 
 
 		 596 aa  819    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1796  short chain dehydrogenase  51.46 
 
 		 590 aa  588  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  51.11 
 
 		 592 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  46.74 
 
 		 590 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.93 
 
 		 602 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  47.28 
 
 		 568 aa  451  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 		 588 aa  434  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  41.71 
 
 		 592 aa  413  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  41.64 
 
 		 588 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  41.64 
 
 		 588 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  41.64 
 
 		 588 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1384  alpha/beta hydrolase fold  58.03 
 
 		 320 aa  352  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2937  short chain dehydrogenase  36.32 
 
 		 543 aa  328  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  56.82 
 
 		 340 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3576  short chain dehydrogenase  37.63 
 
 		 538 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129186  normal  0.037556 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4650  alpha/beta hydrolase fold protein  51.06 
 
 		 342 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0286073 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4518  alpha/beta hydrolase fold  51.06 
 
 		 342 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0590754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1474  alpha/beta fold family hydrolase  48.54 
 
 		 316 aa  257  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1142  Alpha/beta hydrolase  48.7 
 
 		 307 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3691  alpha/beta hydrolase fold  48.7 
 
 		 312 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4677  alpha/beta hydrolase fold  48.7 
 
 		 312 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246976  normal  0.206505 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5623  alpha/beta hydrolase fold  48.7 
 
 		 312 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4529  alpha/beta hydrolase fold  47.69 
 
 		 311 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.190868 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3548  alpha/beta hydrolase fold  46.83 
 
 		 293 aa  251  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4016  alpha/beta hydrolase fold  48.34 
 
 		 303 aa  251  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459613  normal  0.722956 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1344  alpha/beta fold family hydrolase  47.45 
 
 		 317 aa  250  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1006  alpha/beta fold family hydrolase  47.45 
 
 		 317 aa  250  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36915  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2522  alpha/beta fold family hydrolase  47.45 
 
 		 317 aa  250  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1267  alpha/beta fold family hydrolase  47.45 
 
 		 317 aa  250  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0561  EphD  47.45 
 
 		 317 aa  250  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.284331  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4071  alpha/beta hydrolase fold  47.94 
 
 		 310 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  46.88 
 
 		 315 aa  246  8e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4876  alpha/beta hydrolase fold  45.73 
 
 		 321 aa  237  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000503768  normal  0.514103 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1792  putative hydrolase  45.83 
 
 		 316 aa  232  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000565691 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1140  alpha/beta fold family hydrolase  39.07 
 
 		 308 aa  200  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2521  alpha/beta fold family hydrolase  37.96 
 
 		 750 aa  200  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2091  alpha/beta fold family hydrolase  39.07 
 
 		 308 aa  200  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2203  alpha/beta fold family hydrolase  39.07 
 
 		 308 aa  200  7e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1296  alpha/beta fold family hydrolase  39.07 
 
 		 308 aa  200  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0689  alpha/beta fold family hydrolase  39.07 
 
 		 308 aa  200  7e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1132  alpha/beta fold family hydrolase  39.07 
 
 		 308 aa  200  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.366992  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2355  alpha/beta fold family hydrolase  43.28 
 
 		 345 aa  197  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110523  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 275 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  42.78 
 
 		 292 aa  148  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0476  alpha/beta hydrolase fold protein  34.59 
 
 		 298 aa  145  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 		 284 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 		 284 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 		 284 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.54 
 
 		 267 aa  140  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 		 278 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.05 
 
 		 278 aa  139  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.21 
 
 		 277 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.01 
 
 		 278 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  34.3 
 
 		 295 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  32.08 
 
 		 273 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.44 
 
 		 279 aa  132  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  40.2 
 
 		 301 aa  132  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  32.36 
 
 		 295 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2681  short chain dehydrogenase family protein  31.25 
 
 		 273 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  42.19 
 
 		 257 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 		 275 aa  127  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 		 261 aa  127  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 		 295 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 273 aa  126  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 		 273 aa  126  9e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0626824  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2561  hypothetical protein  39.09 
 
 		 301 aa  126  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.226357  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 		 261 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  38.02 
 
 		 289 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2914  hypothetical protein  34.52 
 
 		 301 aa  125  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.58 
 
 		 247 aa  125  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1700  hypothetical protein  36.71 
 
 		 301 aa  124  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 		 267 aa  124  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.49838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_642  oxidoreductase, short chain dehydrogenase  36.44 
 
 		 265 aa  124  5e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100952  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2003  hypothetical protein  36.71 
 
 		 301 aa  124  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122286  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.97 
 
 		 280 aa  123  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.370364  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 		 252 aa  123  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 275 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2833  hypothetical protein  38.54 
 
 		 309 aa  123  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 		 258 aa  123  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 		 278 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000841338  hitchhiker  0.00141318 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1820  short chain dehydrogenase  34.72 
 
 		 267 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 		 280 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 		 265 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.159524  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 		 309 aa  122  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 		 268 aa  121  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 		 285 aa  121  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 		 289 aa  121  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0093  glucose/ribitol dehydrogenase  39.89 
 
 		 259 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>