More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0093 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0093  glucose/ribitol dehydrogenase  100 
 
 		 259 aa  519  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0232  acetoin reductases  76.06 
 
 		 259 aa  410  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0838  acetoin reductase  71.81 
 
 		 259 aa  380  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.387931 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2541  acetoin reductases  69.5 
 
 		 259 aa  372  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0776085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0124  acetoin reductase  68.94 
 
 		 264 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172897  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1091  acetoin reductase  68.66 
 
 		 268 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0789  acetoin reductases  68.94 
 
 		 264 aa  354  8.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.867312  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0358  acetoin reductase  69.88 
 
 		 259 aa  353  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.110663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0618  acetoin reductases  64.5 
 
 		 270 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.431987 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4158  acetoin reductase  61.39 
 
 		 257 aa  302  3.0000000000000004e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0638  acetoin reductases  64.5 
 
 		 285 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.140938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0625  alcohol dehydrogenase family protein  64.5 
 
 		 285 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0750479  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0974  acetoin reductase  60.47 
 
 		 257 aa  298  6e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2028  acetoin reductase  58.5 
 
 		 256 aa  295  4e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0990  acetoin reductase  58.33 
 
 		 257 aa  292  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0303  acetoin reductase  54.94 
 
 		 257 aa  276  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0296  acetoin reductase  56.13 
 
 		 257 aa  269  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2379  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  50.98 
 
 		 257 aa  263  3e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.303229  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0077  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  46.92 
 
 		 260 aa  243  3e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.840544  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0113  acetoin reductase  49.61 
 
 		 258 aa  242  5e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0117  acetoin reductase  49.61 
 
 		 258 aa  242  5e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1148  Short-chain alcohol dehydrogenase  51.38 
 
 		 253 aa  242  5e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2068  putative L-2,3-butanediol dehydrogenase  49.8 
 
 		 261 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000343042  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1449  acetoin reductase  48.82 
 
 		 257 aa  240  2e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000100161  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32140  acetoin reductase family protein  49.42 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.206629 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.43 
 
 		 283 aa  235  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0974  acetoin reductase  46.85 
 
 		 253 aa  226  2e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0145  acetoin reductase  47.67 
 
 		 258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000146421  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0693  acetoin reductase  47.49 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0373787  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0903  acetoin reductase, putative  46.92 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0117  acetoin reductase  46.51 
 
 		 258 aa  219  5e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.713741  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0523  acetoin reductase  46.85 
 
 		 254 aa  218  6e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0841243  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2257  acetoin reductase  46.33 
 
 		 262 aa  218  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0363  acetoin reductase  46.75 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1602  acetoin reductase  44.92 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 		 260 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.19 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.138148 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.21 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0184559 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 		 260 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41710  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 264 aa  178  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.7 
 
 		 247 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 		 258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 		 258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 		 248 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05373  conserved hypothetical protein  39.11 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00512798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.77 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0298629  hitchhiker  0.00223768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.62 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.243411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.4 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0298  sorbitol dehydrogenase  36.47 
 
 		 262 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0868  sorbitol dehydrogenase  37.11 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1031  sorbitol dehydrogenase  37.11 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0872  sorbitol dehydrogenase  37.11 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.06 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.246976  hitchhiker  0.0018719 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0330  sorbitol dehydrogenase  36.72 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.264194  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0692  sorbitol dehydrogenase  37.11 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0076  sorbitol dehydrogenase  36.72 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2462  sorbitol dehydrogenase  36.72 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0628  sorbitol dehydrogenase  36.72 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5141  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.38 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116654  normal  0.551498 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2111  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00668393  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 		 247 aa  159  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3580  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.01 
 
 		 246 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10280  putative short-chain dehydrogenase  40.54 
 
 		 266 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 		 262 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351696  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3663  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.61 
 
 		 246 aa  158  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 		 263 aa  158  9e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3314  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.01 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3563  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.01 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0125613 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3570  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.61 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1654  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.61 
 
 		 246 aa  156  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0676994 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3264  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.01 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3571  sorbitol dehydrogenase  36.22 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3349  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.61 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.06131  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.61 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3247  sorbitol dehydrogenase  36.86 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0320221  normal  0.626785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0719  sorbitol dehydrogenase  36.86 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000035805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3850  sorbitol dehydrogenase  36.86 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.69 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282314 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0427  sorbitol dehydrogenase  37.11 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal  0.619878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5929  sorbitol dehydrogenase  35.94 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3781  sorbitol dehydrogenase  38.65 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.360615  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1731  sorbitol dehydrogenase  36.86 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2622  sorbitol dehydrogenase  35.55 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.96 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  36.96 
 
 		 250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.162194 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0699  sorbitol dehydrogenase  35.94 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.504553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0489  sorbitol dehydrogenase  35.69 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000937678  hitchhiker  0.00159634 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0269  sorbitol dehydrogenase  38.04 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2514  sorbitol dehydrogenase  35.55 
 
 		 258 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.449953 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2646  sorbitol dehydrogenase  35.55 
 
 		 258 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 		 267 aa  152  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.649752  normal  0.721857 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2396  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.87 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084933  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0095  sorbitol dehydrogenase  36.47 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.96 
 
 		 247 aa  150  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1988  sorbitol dehydrogenase  35.86 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.921173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2598  sorbitol dehydrogenase  35.86 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>