More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3132 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_3132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
261 aa  528  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.37 
 
 
260 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.85 
 
 
260 aa  335  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2396  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  58.87 
 
 
266 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084933  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.2 
 
 
265 aa  294  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.06 
 
 
265 aa  293  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.71 
 
 
260 aa  193  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.53 
 
 
246 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282314 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2068  putative L-2,3-butanediol dehydrogenase  38.61 
 
 
261 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000343042  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0838  acetoin reductase  39.61 
 
 
259 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.387931 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
283 aa  178  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 
247 aa  176  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0232  acetoin reductases  37.8 
 
 
259 aa  176  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0358  acetoin reductase  43.7 
 
 
259 aa  175  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.110663  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32140  acetoin reductase family protein  40.86 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.206629 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.62 
 
 
247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.138148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 
251 aa  172  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0303  acetoin reductase  38.82 
 
 
257 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4158  acetoin reductase  42.52 
 
 
257 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436018  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.7 
 
 
258 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0298629  hitchhiker  0.00223768 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.7 
 
 
258 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.7 
 
 
258 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
254 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
262 aa  167  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5141  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.7 
 
 
258 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116654  normal  0.551498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0298  sorbitol dehydrogenase  39 
 
 
262 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514875  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3663  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.38 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41710  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0974  acetoin reductase  38.82 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.05 
 
 
245 aa  166  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1654  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40 
 
 
246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0676994 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3570  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40 
 
 
246 aa  165  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3580  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2371  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase / Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0124  acetoin reductase  37.84 
 
 
264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172897  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0093  glucose/ribitol dehydrogenase  38.19 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.54 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.246976  hitchhiker  0.0018719 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
256 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0296  acetoin reductase  38.76 
 
 
257 aa  162  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.38 
 
 
246 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 
248 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.961994  normal  0.547574 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2541  acetoin reductases  37.11 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0776085  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.26 
 
 
250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00209821  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
254 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3314  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39 
 
 
246 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3563  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39 
 
 
246 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0125613 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0659  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.58 
 
 
245 aa  161  1e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.372694  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0269  sorbitol dehydrogenase  39.62 
 
 
263 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 
250 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4841  sorbitol dehydrogenase  36.86 
 
 
256 aa  161  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0994  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.7 
 
 
248 aa  161  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.931337 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0197  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.15 
 
 
245 aa  160  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3264  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39 
 
 
246 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0903  acetoin reductase, putative  34.83 
 
 
269 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.08 
 
 
246 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3832  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
260 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.919217  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
260 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.136099 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.4 
 
 
247 aa  159  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
248 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2906  sorbitol dehydrogenase  36.78 
 
 
255 aa  159  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.205438 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1113  sorbitol dehydrogenase  35.77 
 
 
262 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3850  sorbitol dehydrogenase  36.08 
 
 
256 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3349  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.62 
 
 
246 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.06131  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.62 
 
 
246 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0990  acetoin reductase  37.65 
 
 
257 aa  159  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2421  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 
263 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 
263 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.814737  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
256 aa  158  9e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1091  acetoin reductase  36.12 
 
 
268 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 
270 aa  157  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
263 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.668551  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0363  sorbitol dehydrogenase  35.11 
 
 
257 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0131  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.6 
 
 
245 aa  156  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120855  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
252 aa  156  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0789  acetoin reductases  37.84 
 
 
264 aa  156  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.867312  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.69 
 
 
246 aa  156  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.08 
 
 
246 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.16 
 
 
247 aa  156  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2028  acetoin reductase  36.47 
 
 
256 aa  155  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4813  sorbitol dehydrogenase  36.6 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0167  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.37 
 
 
245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.619009  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0427  sorbitol dehydrogenase  34.75 
 
 
256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal  0.619878 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.8 
 
 
248 aa  155  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
245 aa  155  6e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0934  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.91 
 
 
247 aa  155  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00491532  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2588  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.64 
 
 
248 aa  155  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.05 
 
 
245 aa  155  8e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0695  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.79 
 
 
247 aa  155  8e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0249  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
258 aa  155  8e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0279472  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.11 
 
 
246 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0509  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.38 
 
 
245 aa  154  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 
252 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.07 
 
 
246 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3989  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.07 
 
 
246 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0408742  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0638  sorbitol dehydrogenase  37.35 
 
 
261 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.122771  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.28 
 
 
246 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.28 
 
 
246 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>