More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3781 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3781  sorbitol dehydrogenase  100 
 
 		 257 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.360615  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3571  sorbitol dehydrogenase  82.75 
 
 		 258 aa  438  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0363  sorbitol dehydrogenase  80.16 
 
 		 257 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4813  sorbitol dehydrogenase  78.21 
 
 		 257 aa  410  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2354  sorbitol dehydrogenase  80.54 
 
 		 257 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0095  sorbitol dehydrogenase  78.04 
 
 		 256 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1731  sorbitol dehydrogenase  77.65 
 
 		 256 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0427  sorbitol dehydrogenase  75.69 
 
 		 256 aa  395  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal  0.619878 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0638  sorbitol dehydrogenase  67.31 
 
 		 261 aa  352  2.9999999999999997e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.122771  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4841  sorbitol dehydrogenase  67.06 
 
 		 256 aa  349  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3850  sorbitol dehydrogenase  66.41 
 
 		 256 aa  349  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2906  sorbitol dehydrogenase  68.09 
 
 		 255 aa  347  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.205438 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0464  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.26 
 
 		 257 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0692  sorbitol dehydrogenase  61.48 
 
 		 258 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0330  sorbitol dehydrogenase  60.47 
 
 		 258 aa  305  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.264194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0628  sorbitol dehydrogenase  60.47 
 
 		 258 aa  305  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0076  sorbitol dehydrogenase  60.47 
 
 		 258 aa  305  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2462  sorbitol dehydrogenase  60.47 
 
 		 258 aa  305  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5929  sorbitol dehydrogenase  61.63 
 
 		 258 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1988  sorbitol dehydrogenase  61.24 
 
 		 276 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.921173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2598  sorbitol dehydrogenase  61.24 
 
 		 276 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0872  sorbitol dehydrogenase  59.92 
 
 		 258 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0868  sorbitol dehydrogenase  59.92 
 
 		 258 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1031  sorbitol dehydrogenase  59.92 
 
 		 258 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2622  sorbitol dehydrogenase  61.24 
 
 		 258 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0699  sorbitol dehydrogenase  60.85 
 
 		 258 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.504553 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0719  sorbitol dehydrogenase  59.85 
 
 		 260 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000035805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2646  sorbitol dehydrogenase  60.47 
 
 		 258 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2514  sorbitol dehydrogenase  60.08 
 
 		 258 aa  301  9e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.449953 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3247  sorbitol dehydrogenase  59.46 
 
 		 260 aa  298  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0320221  normal  0.626785 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2147  sorbitol dehydrogenase  58.91 
 
 		 256 aa  296  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000207425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0489  sorbitol dehydrogenase  57.92 
 
 		 260 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000937678  hitchhiker  0.00159634 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3166  sorbitol dehydrogenase  53.08 
 
 		 269 aa  269  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0138901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1113  sorbitol dehydrogenase  56.49 
 
 		 262 aa  261  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0298  sorbitol dehydrogenase  52.94 
 
 		 262 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0269  sorbitol dehydrogenase  52.73 
 
 		 263 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 252 aa  221  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.167955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0838  acetoin reductase  39.92 
 
 		 259 aa  176  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.387931 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0303  acetoin reductase  39.11 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.138148 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  39.06 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0974  acetoin reductase  37.94 
 
 		 257 aa  169  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0990  acetoin reductase  37.35 
 
 		 257 aa  168  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2028  acetoin reductase  37.2 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.649752  normal  0.721857 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0117  acetoin reductase  37.85 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0232  acetoin reductases  38.34 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0113  acetoin reductase  37.85 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2541  acetoin reductases  39.2 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0776085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0296  acetoin reductase  39.92 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1091  acetoin reductase  38.93 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 		 275 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 		 260 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1655  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 		 261 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0365832  normal  0.0290451 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1896  short chain dehydrogenase  39.22 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1985  short chain dehydrogenase  38.02 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2379  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.25 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.303229  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1568  short chain dehydrogenase  35.96 
 
 		 301 aa  158  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2396  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.83 
 
 		 266 aa  158  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084933  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0358  acetoin reductase  38.74 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.110663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  36.15 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32140  acetoin reductase family protein  35.27 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.206629 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3083  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192229  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0903  acetoin reductase, putative  36.64 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 		 246 aa  156  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3017  short chain dehydrogenase  37.36 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0077  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  35.57 
 
 		 260 aa  155  7e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.840544  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4577  short chain dehydrogenase  39.3 
 
 		 253 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4665  short chain dehydrogenase  39.3 
 
 		 253 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4960  short chain dehydrogenase  39.3 
 
 		 253 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.74 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2111  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00668393  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0093  glucose/ribitol dehydrogenase  38.65 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.28 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.67 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5156  short chain dehydrogenase  38.91 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 		 261 aa  152  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0974  acetoin reductase  36.03 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1148  Short-chain alcohol dehydrogenase  36.44 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1629  short chain dehydrogenase  38.8 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0124  acetoin reductase  37.07 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172897  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1601  short chain dehydrogenase  38.91 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.786043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3725  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725023  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4158  acetoin reductase  37.7 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4068  short chain dehydrogenase  38.8 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2389  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.13 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 		 250 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1573  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 		 257 aa  150  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0631529  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 277 aa  149  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 		 251 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>