More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4042 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 261 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0184559 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.28 
 
 		 262 aa  323  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.138148 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 		 267 aa  211  7.999999999999999e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.649752  normal  0.721857 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0232  acetoin reductases  45.17 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2028  acetoin reductase  46.27 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0838  acetoin reductase  45.56 
 
 		 259 aa  206  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.387931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1091  acetoin reductase  46.27 
 
 		 268 aa  205  5e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0077  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  41.18 
 
 		 260 aa  204  2e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.840544  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0093  glucose/ribitol dehydrogenase  45.17 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2379  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.02 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.303229  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 		 283 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2541  acetoin reductases  44.79 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0776085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0358  acetoin reductase  44.79 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.110663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0124  acetoin reductase  43.94 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172897  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0303  acetoin reductase  45.24 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4158  acetoin reductase  46.69 
 
 		 257 aa  191  9e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0990  acetoin reductase  44.57 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0296  acetoin reductase  46.03 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2111  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 		 267 aa  188  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00668393  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0789  acetoin reductases  45.08 
 
 		 264 aa  188  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.867312  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0974  acetoin reductase  44.49 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32140  acetoin reductase family protein  41.2 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.206629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.38 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0145  acetoin reductase  41.47 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000146421  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1148  Short-chain alcohol dehydrogenase  43.19 
 
 		 253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0618  acetoin reductases  45.64 
 
 		 270 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.431987 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0638  acetoin reductases  45.64 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.140938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0625  alcohol dehydrogenase family protein  45.64 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0750479  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.75 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0903  acetoin reductase, putative  39.1 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0113  acetoin reductase  40.86 
 
 		 258 aa  175  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0117  acetoin reductase  40.86 
 
 		 258 aa  175  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2068  putative L-2,3-butanediol dehydrogenase  37.84 
 
 		 261 aa  174  9e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000343042  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1449  acetoin reductase  39.92 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000100161  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0693  acetoin reductase  41.38 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0373787  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0974  acetoin reductase  41.43 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5929  sorbitol dehydrogenase  40.78 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0692  sorbitol dehydrogenase  41.18 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3850  sorbitol dehydrogenase  40.15 
 
 		 256 aa  168  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2257  acetoin reductase  41.7 
 
 		 262 aa  169  6e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1988  sorbitol dehydrogenase  40.39 
 
 		 276 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.921173  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2646  sorbitol dehydrogenase  40.16 
 
 		 258 aa  168  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2598  sorbitol dehydrogenase  40.39 
 
 		 276 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2622  sorbitol dehydrogenase  40.39 
 
 		 258 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0872  sorbitol dehydrogenase  40.78 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2514  sorbitol dehydrogenase  40.16 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.449953 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1031  sorbitol dehydrogenase  40.78 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0868  sorbitol dehydrogenase  40.78 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.287432  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2462  sorbitol dehydrogenase  40.78 
 
 		 258 aa  165  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0330  sorbitol dehydrogenase  40.78 
 
 		 258 aa  165  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.264194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0628  sorbitol dehydrogenase  40.78 
 
 		 258 aa  165  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0076  sorbitol dehydrogenase  40.78 
 
 		 258 aa  165  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0699  sorbitol dehydrogenase  40 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.504553 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0117  acetoin reductase  39.15 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.713741  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0523  acetoin reductase  40.39 
 
 		 254 aa  161  9e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0841243  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2147  sorbitol dehydrogenase  39.22 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000207425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41710  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5141  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116654  normal  0.551498 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0489  sorbitol dehydrogenase  38.04 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000937678  hitchhiker  0.00159634 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4841  sorbitol dehydrogenase  38.43 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.66 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.66 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.19 
 
 		 258 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0298629  hitchhiker  0.00223768 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.28 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0427  sorbitol dehydrogenase  38.58 
 
 		 256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal  0.619878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0719  sorbitol dehydrogenase  37.25 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000035805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0363  sorbitol dehydrogenase  38.37 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.246976  hitchhiker  0.0018719 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3247  sorbitol dehydrogenase  36.86 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0320221  normal  0.626785 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3781  sorbitol dehydrogenase  38.52 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.360615  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.31 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1936  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.37 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000245701  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3166  sorbitol dehydrogenase  37.69 
 
 		 269 aa  152  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0138901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.86 
 
 		 245 aa  152  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 256 aa  152  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.31 
 
 		 255 aa  151  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  33.73 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.79 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4813  sorbitol dehydrogenase  38.37 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.5 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  33.33 
 
 		 247 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.58 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 		 250 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 		 248 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.37 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 252 aa  149  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.62 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.245983 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  35.16 
 
 		 255 aa  149  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 		 248 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>