More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0789 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0789  acetoin reductases  100 
 
 		 264 aa  524  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.867312  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0124  acetoin reductase  87.12 
 
 		 264 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172897  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0618  acetoin reductases  80.92 
 
 		 270 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.431987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0625  alcohol dehydrogenase family protein  80.92 
 
 		 285 aa  374  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0750479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0638  acetoin reductases  80.92 
 
 		 285 aa  374  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.140938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0093  glucose/ribitol dehydrogenase  68.94 
 
 		 259 aa  367  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1091  acetoin reductase  68.66 
 
 		 268 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0232  acetoin reductases  69.7 
 
 		 259 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0838  acetoin reductase  70.83 
 
 		 259 aa  365  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.387931 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2541  acetoin reductases  68.18 
 
 		 259 aa  350  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0776085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0358  acetoin reductase  67.05 
 
 		 259 aa  334  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.110663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4158  acetoin reductase  63.02 
 
 		 257 aa  301  7.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0990  acetoin reductase  56.15 
 
 		 257 aa  268  7e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2028  acetoin reductase  54.65 
 
 		 256 aa  268  8.999999999999999e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0974  acetoin reductase  54.41 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0303  acetoin reductase  52.11 
 
 		 257 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32140  acetoin reductase family protein  52.69 
 
 		 262 aa  244  8e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.206629 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0296  acetoin reductase  53.49 
 
 		 257 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2379  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  48.46 
 
 		 257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.303229  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0903  acetoin reductase, putative  49.62 
 
 		 269 aa  228  8e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2068  putative L-2,3-butanediol dehydrogenase  47.31 
 
 		 261 aa  226  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000343042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0117  acetoin reductase  48.28 
 
 		 258 aa  226  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0113  acetoin reductase  48.28 
 
 		 258 aa  226  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1449  acetoin reductase  45.8 
 
 		 257 aa  224  2e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000100161  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0077  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  46.04 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.840544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.15 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1148  Short-chain alcohol dehydrogenase  48.84 
 
 		 253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0145  acetoin reductase  46.9 
 
 		 258 aa  219  5e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000146421  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0117  acetoin reductase  45.63 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.713741  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0974  acetoin reductase  45.17 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2257  acetoin reductase  46.33 
 
 		 262 aa  207  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0693  acetoin reductase  43.18 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0373787  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1602  acetoin reductase  47.51 
 
 		 257 aa  199  5e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0523  acetoin reductase  44.02 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0841243  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0363  acetoin reductase  43.64 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 260 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 260 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.54 
 
 		 261 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0184559 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.138148 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05373  conserved hypothetical protein  40.36 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00512798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 		 261 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41710  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 264 aa  162  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0076  sorbitol dehydrogenase  40.08 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2462  sorbitol dehydrogenase  40.08 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0330  sorbitol dehydrogenase  40.08 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.264194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0628  sorbitol dehydrogenase  40.08 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 		 262 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351696  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0868  sorbitol dehydrogenase  39.69 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1031  sorbitol dehydrogenase  39.69 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0872  sorbitol dehydrogenase  39.69 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.649752  normal  0.721857 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0692  sorbitol dehydrogenase  39.69 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0719  sorbitol dehydrogenase  40.38 
 
 		 260 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000035805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0699  sorbitol dehydrogenase  39.85 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.504553 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2622  sorbitol dehydrogenase  39.08 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2514  sorbitol dehydrogenase  39.08 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.449953 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0427  sorbitol dehydrogenase  38.46 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal  0.619878 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1988  sorbitol dehydrogenase  39 
 
 		 276 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.921173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2598  sorbitol dehydrogenase  39 
 
 		 276 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3850  sorbitol dehydrogenase  38.08 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0095  sorbitol dehydrogenase  37.69 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2646  sorbitol dehydrogenase  38.7 
 
 		 258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1731  sorbitol dehydrogenase  38.08 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5929  sorbitol dehydrogenase  38.7 
 
 		 258 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3860  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.54 
 
 		 249 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.840744  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1852  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.54 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3571  sorbitol dehydrogenase  37.84 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.16 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3247  sorbitol dehydrogenase  39.62 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0320221  normal  0.626785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0363  sorbitol dehydrogenase  38.61 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0489  sorbitol dehydrogenase  38.22 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000937678  hitchhiker  0.00159634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2111  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.74 
 
 		 267 aa  148  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00668393  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.38 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.44 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0802156  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2396  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.96 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084933  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3781  sorbitol dehydrogenase  36.68 
 
 		 257 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.360615  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.15 
 
 		 246 aa  145  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282314 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 251 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 		 262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 247 aa  145  8.000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  37.02 
 
 		 250 aa  145  9e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.162194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2354  sorbitol dehydrogenase  38.22 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.64 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2147  sorbitol dehydrogenase  38.22 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000207425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.52 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10280  putative short-chain dehydrogenase  40 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3663  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.29 
 
 		 246 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  38.08 
 
 		 255 aa  142  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 		 248 aa  142  7e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3314  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.29 
 
 		 246 aa  142  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.88 
 
 		 245 aa  142  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3563  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.29 
 
 		 246 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0125613 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.31 
 
 		 245 aa  142  8e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1654  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.29 
 
 		 246 aa  141  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0676994 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3580  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.29 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.46 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>