More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3850 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3850  sorbitol dehydrogenase  100 
 
 
256 aa  510  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3781  sorbitol dehydrogenase  66.41 
 
 
257 aa  349  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.360615  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3571  sorbitol dehydrogenase  65.1 
 
 
258 aa  344  8e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1731  sorbitol dehydrogenase  66.02 
 
 
256 aa  341  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311786  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0095  sorbitol dehydrogenase  66.02 
 
 
256 aa  340  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0427  sorbitol dehydrogenase  64.84 
 
 
256 aa  335  2.9999999999999997e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal  0.619878 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0363  sorbitol dehydrogenase  62.75 
 
 
257 aa  333  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4841  sorbitol dehydrogenase  61.33 
 
 
256 aa  328  7e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4813  sorbitol dehydrogenase  62.2 
 
 
257 aa  322  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2354  sorbitol dehydrogenase  63.53 
 
 
257 aa  322  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0638  sorbitol dehydrogenase  58.62 
 
 
261 aa  305  6e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.122771  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2906  sorbitol dehydrogenase  62.11 
 
 
255 aa  296  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.205438 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2646  sorbitol dehydrogenase  54.41 
 
 
258 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5929  sorbitol dehydrogenase  54.79 
 
 
258 aa  280  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2514  sorbitol dehydrogenase  54.41 
 
 
258 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.449953 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2462  sorbitol dehydrogenase  53.64 
 
 
258 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0330  sorbitol dehydrogenase  53.64 
 
 
258 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.264194  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0076  sorbitol dehydrogenase  53.64 
 
 
258 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0628  sorbitol dehydrogenase  53.64 
 
 
258 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0699  sorbitol dehydrogenase  54.41 
 
 
258 aa  278  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.504553 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0872  sorbitol dehydrogenase  53.64 
 
 
258 aa  278  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1031  sorbitol dehydrogenase  53.64 
 
 
258 aa  278  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0868  sorbitol dehydrogenase  53.64 
 
 
258 aa  278  7e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0692  sorbitol dehydrogenase  54.02 
 
 
258 aa  278  7e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2622  sorbitol dehydrogenase  54.41 
 
 
258 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1988  sorbitol dehydrogenase  54.02 
 
 
276 aa  275  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.921173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2598  sorbitol dehydrogenase  54.02 
 
 
276 aa  275  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0719  sorbitol dehydrogenase  54.47 
 
 
260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000035805  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3247  sorbitol dehydrogenase  53.61 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0320221  normal  0.626785 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0489  sorbitol dehydrogenase  52.12 
 
 
260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000937678  hitchhiker  0.00159634 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3166  sorbitol dehydrogenase  52.9 
 
 
269 aa  265  8e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0138901  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2147  sorbitol dehydrogenase  52.73 
 
 
256 aa  259  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000207425  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0298  sorbitol dehydrogenase  51.76 
 
 
262 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514875  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0464  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.84 
 
 
257 aa  250  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1113  sorbitol dehydrogenase  51.74 
 
 
262 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0269  sorbitol dehydrogenase  50.2 
 
 
263 aa  238  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.02 
 
 
252 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.167955  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
262 aa  175  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4158  acetoin reductase  41.11 
 
 
257 aa  171  9e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436018  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
250 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
262 aa  170  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 
262 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.138148 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0727  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.3 
 
 
249 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0777  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.9 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4577  short chain dehydrogenase  41.47 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4665  short chain dehydrogenase  41.47 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4960  short chain dehydrogenase  41.47 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  37.11 
 
 
259 aa  166  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2379  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.05 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.303229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5156  short chain dehydrogenase  41.09 
 
 
254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215894  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.91 
 
 
248 aa  162  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0838  acetoin reductase  36.86 
 
 
259 aa  161  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.387931 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1601  short chain dehydrogenase  40.31 
 
 
253 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.786043  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2396  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.62 
 
 
266 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084933  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
255 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0232  acetoin reductases  37.25 
 
 
259 aa  161  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1091  acetoin reductase  36.36 
 
 
268 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
261 aa  159  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.3 
 
 
267 aa  159  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.649752  normal  0.721857 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1985  short chain dehydrogenase  36.6 
 
 
261 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0117  acetoin reductase  37.05 
 
 
258 aa  159  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0113  acetoin reductase  37.05 
 
 
258 aa  159  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3955  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.7 
 
 
249 aa  159  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.572818  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.43 
 
 
246 aa  159  6e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1655  short chain dehydrogenase  36.6 
 
 
261 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0365832  normal  0.0290451 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0077  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  36.72 
 
 
260 aa  158  6e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.840544  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0303  acetoin reductase  36.76 
 
 
257 aa  158  8e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1568  short chain dehydrogenase  36.98 
 
 
301 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2028  acetoin reductase  37.45 
 
 
256 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32140  acetoin reductase family protein  36.51 
 
 
262 aa  157  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.206629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1400  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 
256 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0683679  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.04 
 
 
247 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0358  acetoin reductase  39.22 
 
 
259 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.110663  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.04 
 
 
246 aa  156  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0974  acetoin reductase  37.15 
 
 
257 aa  156  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 
248 aa  155  6e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0093  glucose/ribitol dehydrogenase  36.86 
 
 
259 aa  155  7e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
248 aa  155  8e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.45 
 
 
247 aa  155  8e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
254 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  35.63 
 
 
265 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
265 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
244 aa  153  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
251 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.28 
 
 
245 aa  154  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1803  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.98 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711857  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2643  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.98 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.802213  normal  0.105966 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1693  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.98 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.523034  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2202  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.5 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.43 
 
 
248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0124  acetoin reductase  37.69 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172897  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.37 
 
 
248 aa  152  4e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 
260 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.12 
 
 
246 aa  152  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0145  acetoin reductase  36.51 
 
 
258 aa  152  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000146421  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0974  acetoin reductase  36.84 
 
 
253 aa  152  5e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
250 aa  152  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
283 aa  152  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>