More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0489 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0489  sorbitol dehydrogenase  100 
 
 
260 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000937678  hitchhiker  0.00159634 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3247  sorbitol dehydrogenase  87.69 
 
 
260 aa  474  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0320221  normal  0.626785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0719  sorbitol dehydrogenase  88.08 
 
 
260 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000035805  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0699  sorbitol dehydrogenase  85.21 
 
 
258 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.504553 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0868  sorbitol dehydrogenase  85.6 
 
 
258 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1031  sorbitol dehydrogenase  85.6 
 
 
258 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466971  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5929  sorbitol dehydrogenase  84.05 
 
 
258 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0872  sorbitol dehydrogenase  85.6 
 
 
258 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0692  sorbitol dehydrogenase  85.21 
 
 
258 aa  447  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2622  sorbitol dehydrogenase  84.44 
 
 
258 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1988  sorbitol dehydrogenase  84.44 
 
 
276 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.921173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2598  sorbitol dehydrogenase  84.44 
 
 
276 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0330  sorbitol dehydrogenase  85.21 
 
 
258 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.264194  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2462  sorbitol dehydrogenase  85.21 
 
 
258 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2514  sorbitol dehydrogenase  84.44 
 
 
258 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.449953 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2646  sorbitol dehydrogenase  84.05 
 
 
258 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0076  sorbitol dehydrogenase  85.21 
 
 
258 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0628  sorbitol dehydrogenase  85.21 
 
 
258 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2147  sorbitol dehydrogenase  83.98 
 
 
256 aa  444  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000207425  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3166  sorbitol dehydrogenase  60 
 
 
269 aa  315  5e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0138901  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0638  sorbitol dehydrogenase  60.77 
 
 
261 aa  314  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.122771  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1113  sorbitol dehydrogenase  61.83 
 
 
262 aa  312  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2354  sorbitol dehydrogenase  59.14 
 
 
257 aa  301  9e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0363  sorbitol dehydrogenase  57.2 
 
 
257 aa  300  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3571  sorbitol dehydrogenase  56.11 
 
 
258 aa  296  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3781  sorbitol dehydrogenase  57.92 
 
 
257 aa  293  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.360615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4813  sorbitol dehydrogenase  56.81 
 
 
257 aa  292  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0427  sorbitol dehydrogenase  56.81 
 
 
256 aa  292  3e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal  0.619878 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1731  sorbitol dehydrogenase  57.59 
 
 
256 aa  289  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311786  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0095  sorbitol dehydrogenase  57.59 
 
 
256 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4841  sorbitol dehydrogenase  54.09 
 
 
256 aa  275  6e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2906  sorbitol dehydrogenase  54.09 
 
 
255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.205438 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3850  sorbitol dehydrogenase  52.12 
 
 
256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0464  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.15 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0298  sorbitol dehydrogenase  51.35 
 
 
262 aa  245  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514875  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0269  sorbitol dehydrogenase  49.81 
 
 
263 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.24 
 
 
252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.167955  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0903  acetoin reductase, putative  40.68 
 
 
269 aa  180  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0113  acetoin reductase  39.6 
 
 
258 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0117  acetoin reductase  39.6 
 
 
258 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2068  putative L-2,3-butanediol dehydrogenase  38.55 
 
 
261 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000343042  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 
265 aa  174  9e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0303  acetoin reductase  37.45 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2257  acetoin reductase  40.64 
 
 
262 aa  172  6.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.23 
 
 
283 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32140  acetoin reductase family protein  36.9 
 
 
262 aa  169  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.206629 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
248 aa  169  4e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0838  acetoin reductase  38.34 
 
 
259 aa  169  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.387931 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 
251 aa  168  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
266 aa  168  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.783199  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0232  acetoin reductases  37.55 
 
 
259 aa  168  7e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2383  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.74 
 
 
253 aa  167  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0296  acetoin reductase  36.9 
 
 
257 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0077  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  37.74 
 
 
260 aa  167  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.840544  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2028  acetoin reductase  35.46 
 
 
256 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2396  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  37.17 
 
 
266 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084933  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
260 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0974  acetoin reductase  36.61 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1148  Short-chain alcohol dehydrogenase  38.96 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.83 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0935  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  40.23 
 
 
251 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2379  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.11 
 
 
257 aa  165  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.303229  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 
262 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0987  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  40.23 
 
 
251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3369  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  40.23 
 
 
251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.589225 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  36.92 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1971  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.11 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  36.61 
 
 
251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  35.74 
 
 
265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0145  acetoin reductase  35.97 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000146421  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0990  acetoin reductase  35.66 
 
 
257 aa  163  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.22 
 
 
244 aa  163  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1909  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.5 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00371976  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 
275 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.240969  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3349  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.74 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.143786 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0117  acetoin reductase  36.19 
 
 
258 aa  162  6e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.713741  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 
257 aa  161  8.000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3168  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.35 
 
 
253 aa  161  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3248  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.35 
 
 
253 aa  161  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000371746 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2032  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.11 
 
 
253 aa  161  9e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3233  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.35 
 
 
253 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000782926 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3295  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.5 
 
 
253 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
262 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.365337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3185  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.74 
 
 
253 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358502  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2643  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.82 
 
 
253 aa  159  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.802213  normal  0.105966 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1693  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.82 
 
 
253 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.523034  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2202  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.72 
 
 
253 aa  159  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.11 
 
 
246 aa  159  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1803  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.82 
 
 
253 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711857  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0470  hypothetical protein  38.67 
 
 
254 aa  159  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.11 
 
 
246 aa  158  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
257 aa  158  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2990  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.96 
 
 
253 aa  158  9e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.916776  normal  0.048185 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000923  5-keto-D-gluconate 5-reductase  36.72 
 
 
253 aa  158  9e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4111  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.96 
 
 
253 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000566262 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2989  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.96 
 
 
253 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0709919  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
245 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  35.34 
 
 
259 aa  157  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>