More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0232 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_0232  acetoin reductases  100 
 
 
259 aa  524  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0093  glucose/ribitol dehydrogenase  76.06 
 
 
259 aa  410  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0838  acetoin reductase  72.97 
 
 
259 aa  393  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.387931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1091  acetoin reductase  68.28 
 
 
268 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0124  acetoin reductase  69.7 
 
 
264 aa  372  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172897  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2541  acetoin reductases  69.5 
 
 
259 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0776085  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0358  acetoin reductase  71.81 
 
 
259 aa  362  4e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.110663  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0789  acetoin reductases  69.7 
 
 
264 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.867312  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0618  acetoin reductases  66.92 
 
 
270 aa  319  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.431987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0625  alcohol dehydrogenase family protein  66.92 
 
 
285 aa  318  6e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0750479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0638  acetoin reductases  66.92 
 
 
285 aa  318  6e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.140938  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4158  acetoin reductase  59.54 
 
 
257 aa  301  8.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436018  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0990  acetoin reductase  58.43 
 
 
257 aa  288  4e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0974  acetoin reductase  58.59 
 
 
257 aa  285  5e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2028  acetoin reductase  58.1 
 
 
256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0303  acetoin reductase  55.73 
 
 
257 aa  273  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0296  acetoin reductase  56.13 
 
 
257 aa  263  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2379  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  49.8 
 
 
257 aa  254  9e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.303229  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32140  acetoin reductase family protein  50.98 
 
 
262 aa  252  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.206629 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2068  putative L-2,3-butanediol dehydrogenase  51.37 
 
 
261 aa  247  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000343042  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.91 
 
 
283 aa  238  6.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0077  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  49.23 
 
 
260 aa  238  9e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.840544  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1148  Short-chain alcohol dehydrogenase  51.78 
 
 
253 aa  234  9e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0903  acetoin reductase, putative  50.76 
 
 
269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0117  acetoin reductase  49.21 
 
 
258 aa  229  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0113  acetoin reductase  49.21 
 
 
258 aa  229  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0145  acetoin reductase  47.84 
 
 
258 aa  228  8e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000146421  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1449  acetoin reductase  48.03 
 
 
257 aa  225  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000100161  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0693  acetoin reductase  47.88 
 
 
259 aa  223  2e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0373787  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2257  acetoin reductase  45.56 
 
 
262 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0974  acetoin reductase  48.03 
 
 
253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0523  acetoin reductase  46.46 
 
 
254 aa  206  4e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0841243  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0117  acetoin reductase  43.41 
 
 
258 aa  201  8e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.713741  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.69 
 
 
262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.138148 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1602  acetoin reductase  46.09 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
260 aa  188  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.21 
 
 
261 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0184559 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
260 aa  185  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0363  acetoin reductase  45.02 
 
 
232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3571  sorbitol dehydrogenase  40.32 
 
 
258 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
261 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05373  conserved hypothetical protein  39.71 
 
 
274 aa  171  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00512798  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.3 
 
 
245 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
265 aa  170  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
265 aa  169  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0427  sorbitol dehydrogenase  38.04 
 
 
256 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal  0.619878 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0489  sorbitol dehydrogenase  37.55 
 
 
260 aa  168  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000937678  hitchhiker  0.00159634 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1031  sorbitol dehydrogenase  37.65 
 
 
258 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0872  sorbitol dehydrogenase  37.65 
 
 
258 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
247 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0868  sorbitol dehydrogenase  37.65 
 
 
258 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0692  sorbitol dehydrogenase  37.65 
 
 
258 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41710  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
264 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0298  sorbitol dehydrogenase  38.04 
 
 
262 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514875  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2462  sorbitol dehydrogenase  37.25 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0628  sorbitol dehydrogenase  37.25 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2396  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  35.63 
 
 
266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084933  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0330  sorbitol dehydrogenase  37.25 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.264194  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0076  sorbitol dehydrogenase  37.25 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0719  sorbitol dehydrogenase  37.94 
 
 
260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000035805  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1731  sorbitol dehydrogenase  38.43 
 
 
256 aa  165  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311786  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0363  sorbitol dehydrogenase  39.13 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3781  sorbitol dehydrogenase  38.34 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.360615  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0095  sorbitol dehydrogenase  38.04 
 
 
256 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3247  sorbitol dehydrogenase  37.55 
 
 
260 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0320221  normal  0.626785 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0699  sorbitol dehydrogenase  36.86 
 
 
258 aa  161  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.504553 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.15 
 
 
247 aa  161  9e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3850  sorbitol dehydrogenase  37.25 
 
 
256 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2354  sorbitol dehydrogenase  39.92 
 
 
257 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4841  sorbitol dehydrogenase  36.47 
 
 
256 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0269  sorbitol dehydrogenase  38.04 
 
 
263 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5929  sorbitol dehydrogenase  36.86 
 
 
258 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4813  sorbitol dehydrogenase  38.34 
 
 
257 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2622  sorbitol dehydrogenase  36.47 
 
 
258 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.91 
 
 
248 aa  158  7e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
248 aa  157  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2514  sorbitol dehydrogenase  36.47 
 
 
258 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.449953 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  37.31 
 
 
265 aa  157  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1988  sorbitol dehydrogenase  36.08 
 
 
276 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.921173  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2646  sorbitol dehydrogenase  36.47 
 
 
258 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2598  sorbitol dehydrogenase  36.08 
 
 
276 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 
267 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.649752  normal  0.721857 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2111  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
267 aa  156  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00668393  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 
258 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 
258 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 
246 aa  155  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282314 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  37.84 
 
 
259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.61 
 
 
246 aa  155  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2147  sorbitol dehydrogenase  36.36 
 
 
256 aa  155  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000207425  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  38.13 
 
 
250 aa  155  7e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.162194 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 
250 aa  155  9e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 
258 aa  154  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0298629  hitchhiker  0.00223768 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0197  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.86 
 
 
245 aa  154  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.62 
 
 
246 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.5 
 
 
246 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2906  sorbitol dehydrogenase  37.55 
 
 
255 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.205438 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1850  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  38.89 
 
 
255 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00172962  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3674  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.52 
 
 
246 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119797  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.5 
 
 
245 aa  153  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.28 
 
 
246 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>