More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2541 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2541  acetoin reductases  100 
 
 		 259 aa  521  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0776085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0838  acetoin reductase  71.43 
 
 		 259 aa  383  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.387931 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0093  glucose/ribitol dehydrogenase  69.5 
 
 		 259 aa  382  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0232  acetoin reductases  69.5 
 
 		 259 aa  378  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1091  acetoin reductase  68.66 
 
 		 268 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0124  acetoin reductase  68.56 
 
 		 264 aa  362  3e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172897  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0358  acetoin reductase  68.73 
 
 		 259 aa  358  7e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.110663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0789  acetoin reductases  68.18 
 
 		 264 aa  355  5e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.867312  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0625  alcohol dehydrogenase family protein  63.74 
 
 		 285 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0750479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0638  acetoin reductases  63.74 
 
 		 285 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.140938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0618  acetoin reductases  63.36 
 
 		 270 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.431987 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4158  acetoin reductase  59.16 
 
 		 257 aa  295  7e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0974  acetoin reductase  55.91 
 
 		 257 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0990  acetoin reductase  55.16 
 
 		 257 aa  279  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2028  acetoin reductase  53.54 
 
 		 256 aa  276  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0303  acetoin reductase  53.52 
 
 		 257 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0296  acetoin reductase  54.15 
 
 		 257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2379  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  50.59 
 
 		 257 aa  264  1e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.303229  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1148  Short-chain alcohol dehydrogenase  53.36 
 
 		 253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2068  putative L-2,3-butanediol dehydrogenase  51.76 
 
 		 261 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000343042  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32140  acetoin reductase family protein  52.12 
 
 		 262 aa  250  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.206629 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0077  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  48.66 
 
 		 260 aa  248  6e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.840544  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0903  acetoin reductase, putative  50 
 
 		 269 aa  237  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.91 
 
 		 283 aa  237  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0145  acetoin reductase  48.62 
 
 		 258 aa  235  4e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000146421  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1449  acetoin reductase  47.47 
 
 		 257 aa  233  3e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000100161  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0117  acetoin reductase  46.48 
 
 		 258 aa  229  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0113  acetoin reductase  46.48 
 
 		 258 aa  229  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2257  acetoin reductase  47.49 
 
 		 262 aa  226  3e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0693  acetoin reductase  46.21 
 
 		 259 aa  225  5.0000000000000005e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0373787  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1602  acetoin reductase  47.66 
 
 		 257 aa  218  6e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0974  acetoin reductase  45.67 
 
 		 253 aa  218  8.999999999999998e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0117  acetoin reductase  45.35 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.713741  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0523  acetoin reductase  45.28 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0841243  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0363  acetoin reductase  43.72 
 
 		 232 aa  192  6e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.21 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0184559 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 		 262 aa  182  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.138148 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05373  conserved hypothetical protein  40.96 
 
 		 274 aa  179  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00512798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0095  sorbitol dehydrogenase  39.22 
 
 		 256 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3571  sorbitol dehydrogenase  37.94 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0330  sorbitol dehydrogenase  39.22 
 
 		 258 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.264194  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0076  sorbitol dehydrogenase  39.22 
 
 		 258 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2462  sorbitol dehydrogenase  39.22 
 
 		 258 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0628  sorbitol dehydrogenase  39.22 
 
 		 258 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0692  sorbitol dehydrogenase  38.82 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0868  sorbitol dehydrogenase  38.82 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1031  sorbitol dehydrogenase  38.82 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0872  sorbitol dehydrogenase  38.82 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2111  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.38 
 
 		 267 aa  170  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00668393  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1731  sorbitol dehydrogenase  38.43 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3781  sorbitol dehydrogenase  39.2 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.360615  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 		 248 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0363  sorbitol dehydrogenase  37.94 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.31 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 		 245 aa  165  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2622  sorbitol dehydrogenase  39.22 
 
 		 258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41710  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 		 264 aa  165  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0699  sorbitol dehydrogenase  39.22 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.504553 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2514  sorbitol dehydrogenase  39.22 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.449953 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5929  sorbitol dehydrogenase  38.82 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0427  sorbitol dehydrogenase  36.86 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal  0.619878 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2646  sorbitol dehydrogenase  39.22 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1988  sorbitol dehydrogenase  38.82 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.921173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2598  sorbitol dehydrogenase  38.82 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2147  sorbitol dehydrogenase  40 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000207425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.47 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 		 262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0298  sorbitol dehydrogenase  37.94 
 
 		 262 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2354  sorbitol dehydrogenase  38.58 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.246976  hitchhiker  0.0018719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4813  sorbitol dehydrogenase  37.94 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.13 
 
 		 246 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282314 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.83 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.83 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.83 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0298629  hitchhiker  0.00223768 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0719  sorbitol dehydrogenase  37.4 
 
 		 260 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000035805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5141  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116654  normal  0.551498 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.43 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2906  sorbitol dehydrogenase  37.15 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.205438 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 		 265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.243411  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 		 265 aa  155  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0489  sorbitol dehydrogenase  36.61 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000937678  hitchhiker  0.00159634 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 267 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.649752  normal  0.721857 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.5 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3850  sorbitol dehydrogenase  34.51 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5496  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2816  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.13 
 
 		 257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0638  sorbitol dehydrogenase  36.54 
 
 		 261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.122771  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3247  sorbitol dehydrogenase  36.61 
 
 		 260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0320221  normal  0.626785 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 256 aa  151  8e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0269  sorbitol dehydrogenase  37.55 
 
 		 263 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.58 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.45 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>