More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0296 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0296  acetoin reductase  100 
 
 		 257 aa  521  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0303  acetoin reductase  96.89 
 
 		 257 aa  509  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0974  acetoin reductase  82.49 
 
 		 257 aa  430  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2028  acetoin reductase  81.5 
 
 		 256 aa  432  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0990  acetoin reductase  81.71 
 
 		 257 aa  429  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0974  acetoin reductase  61.81 
 
 		 253 aa  315  6e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1449  acetoin reductase  59.14 
 
 		 257 aa  306  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000100161  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0145  acetoin reductase  58.27 
 
 		 258 aa  304  1.0000000000000001e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000146421  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0117  acetoin reductase  56.92 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0113  acetoin reductase  56.92 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0693  acetoin reductase  54.83 
 
 		 259 aa  289  3e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0373787  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0523  acetoin reductase  57.09 
 
 		 254 aa  288  7e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0841243  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0093  glucose/ribitol dehydrogenase  56.13 
 
 		 259 aa  278  4e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2257  acetoin reductase  54.72 
 
 		 262 aa  278  9e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0232  acetoin reductases  56.13 
 
 		 259 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0838  acetoin reductase  54.05 
 
 		 259 aa  271  6e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.387931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1091  acetoin reductase  52.06 
 
 		 268 aa  266  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2541  acetoin reductases  54.15 
 
 		 259 aa  263  3e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0776085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0124  acetoin reductase  53.1 
 
 		 264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172897  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0789  acetoin reductases  53.49 
 
 		 264 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.867312  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4158  acetoin reductase  53.15 
 
 		 257 aa  243  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0358  acetoin reductase  52.36 
 
 		 259 aa  242  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.110663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32140  acetoin reductase family protein  51.17 
 
 		 262 aa  238  5.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.206629 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0903  acetoin reductase, putative  50.38 
 
 		 269 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2379  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.85 
 
 		 257 aa  229  3e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.303229  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1148  Short-chain alcohol dehydrogenase  50 
 
 		 253 aa  229  3e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.69 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0117  acetoin reductase  45.74 
 
 		 258 aa  216  2e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.713741  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0077  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  44.31 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.840544  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2068  putative L-2,3-butanediol dehydrogenase  43.25 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000343042  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0618  acetoin reductases  51.74 
 
 		 270 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.431987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0625  alcohol dehydrogenase family protein  51.74 
 
 		 285 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0750479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0638  acetoin reductases  51.74 
 
 		 285 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.140938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0363  acetoin reductase  49.57 
 
 		 232 aa  207  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1602  acetoin reductase  46.69 
 
 		 257 aa  201  7e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.71 
 
 		 246 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.41 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.138148 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2147  sorbitol dehydrogenase  39.53 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000207425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2646  sorbitol dehydrogenase  38.8 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.64 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0184559 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2462  sorbitol dehydrogenase  38.4 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0330  sorbitol dehydrogenase  38.4 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.264194  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0076  sorbitol dehydrogenase  38.4 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2622  sorbitol dehydrogenase  38.8 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0628  sorbitol dehydrogenase  38.4 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5929  sorbitol dehydrogenase  38.8 
 
 		 258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1988  sorbitol dehydrogenase  38.8 
 
 		 276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.921173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2598  sorbitol dehydrogenase  38.8 
 
 		 276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2514  sorbitol dehydrogenase  38.8 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.449953 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0692  sorbitol dehydrogenase  38.4 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0699  sorbitol dehydrogenase  39.2 
 
 		 258 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.504553 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0868  sorbitol dehydrogenase  38 
 
 		 258 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1031  sorbitol dehydrogenase  38 
 
 		 258 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0872  sorbitol dehydrogenase  38 
 
 		 258 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3781  sorbitol dehydrogenase  39.92 
 
 		 257 aa  171  9e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.360615  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.96 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0489  sorbitol dehydrogenase  36.9 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000937678  hitchhiker  0.00159634 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3674  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.96 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119797  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3899  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.57 
 
 		 246 aa  168  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000498723  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0719  sorbitol dehydrogenase  38.25 
 
 		 260 aa  168  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000035805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 		 261 aa  168  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3702  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.57 
 
 		 246 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.852261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.57 
 
 		 246 aa  168  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.57 
 
 		 246 aa  168  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3989  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.57 
 
 		 246 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0408742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3865  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.57 
 
 		 246 aa  168  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78131e-47 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 		 260 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0638  sorbitol dehydrogenase  39.2 
 
 		 261 aa  168  9e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.122771  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 		 267 aa  168  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.649752  normal  0.721857 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3893  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.57 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0363  sorbitol dehydrogenase  38.31 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3950  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.57 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1293  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.57 
 
 		 246 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.252649  hitchhiker  0.0000000000000846656 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2503  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.18 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000353478  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3247  sorbitol dehydrogenase  37.45 
 
 		 260 aa  165  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0320221  normal  0.626785 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  40.08 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 		 251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1731  sorbitol dehydrogenase  38.4 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.23 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0095  sorbitol dehydrogenase  38.4 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.82 
 
 		 247 aa  161  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.84 
 
 		 246 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.84 
 
 		 246 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 		 257 aa  162  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0890906  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.45 
 
 		 250 aa  161  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.45 
 
 		 250 aa  161  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.167955  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05373  conserved hypothetical protein  38.52 
 
 		 274 aa  159  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00512798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0736  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.7 
 
 		 264 aa  158  8e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00191984  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  38.85 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4813  sorbitol dehydrogenase  36.9 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>